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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002636`

染色体: Chr02 坐标: 45745808-45746275 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002636`
名称	SmilChr02G002636
描述	uncharacterized SmilChr02G002636
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	45745808 - 45746275 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009604`
GeneID	`131009604`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009604`
原始查询	`SmilChr02G002636`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=48.8; qcov=0.555; evalue=2.85e-22; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=46.6; qcov=0.955; evalue=3.08e-39; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009604

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793002.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057793002.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057793002.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793002.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793002.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:45745829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr2:45745867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C60
`Chr2:45745869`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	B103,B107,B12,B125,B139,B41,B44,B62,B72,B95,C37,C5,C78
`Chr2:45745872`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	B103,B107,B12,B125,B139,B41,B44,B55,B62,B72,B95,C37,C5,C78
`Chr2:45745889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C37
`Chr2:45745917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B18,B20,B99,C70
`Chr2:45745976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B16,B69,C76,C84,C86,D9
`Chr2:45745982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:45745988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B16,B2,B69,C76,C84,C86,D9
`Chr2:45745994`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	B103,B107,B12,B131,B139,B21,B41,B44,B62,B64,B72,B75,B95,C5,C78
`Chr2:45745996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B104,B48,B89
`Chr2:45745996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B48,B89

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793002.1

155 aa

155

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF04827 Plant_tran 1-88 aa PF13359 DDE_Tnp_4 23-79 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793002.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	1	88	4.2e-31	108.9	Plant transposon protein
`XP_057793002.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	23	79	2.3e-06	28.0	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937019.1
ATGGGCTACTATTTGTGCGACGACATATATCCAGAGTGGCGTTGCTTCGTTAAGAGTCCGCCGATGGCAACCAATCCAAAGGAGGCGAGGTTCAAGAAGATGCAAGAATCGGCACGGAAGAATGTCGAATGTGCCTTTGGAGTGCTTCAAGCTCGATGGGGAATCATTCGAAGTCCGGCGCGAGGTTGGTACGTCAACAATCTCAAGGAAATCATGATGTGTTGCATCATTCTCCACAGCATGATTGTTGAGAACGAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009604
ATGGGCTACTATTTGTGCGACGACATATATCCAGAGTGGCGTTGCTTCGTTAAGAGTCCGCCGATGGCAACCAATCCAAAGGAGGCGAGGTTCAAGAAGATGCAAGAATCGGCACGGAAGAATGTCGAATGTGCCTTTGGAGTGCTTCAAGCTCGATGGGGAATCATTCGAAGTCCGGCGCGAGGTTGGTACGTCAACAATCTCAAGGAAATCATGATGTGTTGCATCATTCTCCACAGCATGATTGTTGAGAACGAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793002.1
MGYYLCDDIYPEWRCFVKSPPMATNPKEARFKKMQESARKNVECAFGVLQARWGIIRSPARGWYVNNLKEIMMCCIILHSMIVENEGERAAHWRDDDAGHRASSSDSFESARATPVCFEQYMQRDAILRDRQIHAQLQRDLIEHIWARFRPLQPE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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