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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002646`

染色体: Chr02 坐标: 45853296-45855741 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002646`
名称	SmilChr02G002646
描述	beta-1,2-xylosyltransferase XYXT1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	45853296 - 45855741 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009605`
GeneID	`131009605`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009605`
原始查询	`SmilChr02G002646`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-1,2-xylosyltransferase XYXT1-like
产物	beta-1%2C2-xylosyltransferase XYXT1-like
Arabidopsis	`AT2G41640` (AT2G41640) Glycosyltransferase family 61 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818762] identity=33.3; qcov=0.668; evalue=3.5e-65; confidence=low
Rice	`Os01g0118600` - identity=35.6; qcov=0.701; evalue=1.07e-66; confidence=medium
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF04577 (Glyco_transf_61)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009605

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057793003.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793003.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793003.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793003.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793003.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:45853344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A4,B101,B132,B63,B77,B81,B83
`Chr2:45853374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B69
`Chr2:45853374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:45853375`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B44
`Chr2:45853375`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B44
`Chr2:45853392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr2:45853421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,C32,C68
`Chr2:45853967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:45854100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:45854113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,D11
`Chr2:45854125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr2:45854151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793003.1

521 aa

260

521

Glyco_transf_61

PF04577 Glyco_transf_61 317-429 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793003.1`	Pfam	`PF04577`	Glyco_transf_61	Family	317	429	9.7e-12	46.0	Glycosyltransferase 61

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937020.1
CTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCATGCAACTTTTCTTGCGAGTTCAGTCCGAGGGAAACTTTTGTTCACGAATATTTGATGTTACAGATAGATTTATTCAGTGTTTCTTGTTTTGCGTTGTTGATGGAATTTGGAATATATTCACGTGGAAATGTAGGAATAATTGTGTGTTTAATTTTGGAGTTATCTTTAGCTTTTCTTTCAATCTGAGAATGGAGACGGATCAGCCAAATAAATTCTTCTCGCGTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009605
ATGCAACTTTTCTTGCGAGTTCAGTCCGAGGGAAACTTTTGTTCACGAATATTTGATGTTACAGATAGATTTATTCAGTGTTTCTTGTTTTGCGTTGTTGATGGAATTTGGAATATATTCACGTGGAAATGTAGGAATAATTGTGTGTTTAATTTTGGAGTTATCTTTAGCTTTTCTTTCAATCTGAGAATGGAGACGGATCAGCCAAATAAATTCTTCTCGCGTCTAACGACATCGATCTTCGTCATTGTGCTTCCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793003.1
MQLFLRVQSEGNFCSRIFDVTDRFIQCFLFCVVDGIWNIFTWKCRNNCVFNFGVIFSFSFNLRMETDQPNKFFSRLTTSIFVIVLPLLFVDIMWGNIAYFQQRSNYSPAQTISTTTAATKSVGDSDSLDFVLSRLVQGEDLKSFRATGFGCDTQEHSKHCITNRAAHIDTTTMTVTIPSEDPFMNEMTLHPYARQEDKTLIEKVTPVRIVRGKMMAPPPPCDYSHNIPAVVFSTSGFVGNTFHEMDETIIPLFITTFLFN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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