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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002658`

染色体: Chr02 坐标: 46013526-46016442 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002658`
名称	SmilChr02G002658
描述	glycine-rich RNA-binding protein RZ1A
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	46013526 - 46016442 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011701`
GeneID	`131011701`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011701`
原始查询	`SmilChr02G002658`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycine-rich RNA-binding protein RZ1A
产物	glycine-rich RNA-binding protein RZ1A
Arabidopsis	`AT3G26420` (ATRZ-1A) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822246] identity=48.5; qcov=1.23; evalue=4.72e-51; confidence=high
Rice	`Os03g0836200` (OsRZ1) - identity=67.3; qcov=0.579; evalue=8.39e-41; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF00098 (zf-CCHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011701

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795477.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057795477.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.80000	`XP_057795477.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057795477.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795477.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:46014527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,C2,C32,C68
`Chr2:46014537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B78,D6
`Chr2:46015435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr2:46015841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795477.1

221 aa

110

221

RRM_1

zf-CCHC

PF00076 RRM_1 10-78 aa PF00098 zf-CCHC 124-139 aa

XP_057795478.1

221 aa

110

221

RRM_1

zf-CCHC

PF00076 RRM_1 10-78 aa PF00098 zf-CCHC 124-139 aa

XP_057795479.1

221 aa

110

221

RRM_1

zf-CCHC

PF00076 RRM_1 10-78 aa PF00098 zf-CCHC 124-139 aa

XP_057795480.1

190 aa

190

RRM_1

zf-CCHC

PF00076 RRM_1 6-47 aa PF00098 zf-CCHC 93-108 aa

XP_057795481.1

190 aa

190

RRM_1

zf-CCHC

PF00076 RRM_1 6-47 aa PF00098 zf-CCHC 93-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795477.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	10	78	1.3e-22	80.1	RNA recognition motif
`XP_057795477.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	124	139	6.2e-08	33.1	Zinc knuckle
`XP_057795478.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	10	78	1.3e-22	80.1	RNA recognition motif
`XP_057795478.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	124	139	6.2e-08	33.1	Zinc knuckle
`XP_057795479.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	10	78	1.3e-22	80.1	RNA recognition motif
`XP_057795479.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	124	139	6.2e-08	33.1	Zinc knuckle
`XP_057795480.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	6	47	1.4e-11	44.8	RNA recognition motif
`XP_057795480.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	93	108	5.9e-08	33.2	Zinc knuckle
`XP_057795481.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	6	47	1.4e-11	44.8	RNA recognition motif
`XP_057795481.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	93	108	5.9e-08	33.2	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939494.1
TCTCAAGGTAGAAGGGTGCACATGTAATTTTGAATAATTCAGAGACGAAAAGGAGAATATAGGGTTTTTGGAAACGCTAAATCCTCAAACCAGAAGCTGCTCGTCGCTCCCACTCCAACGCCCAAATCGCAGCCGCGCAGTGAATATGGGGGATCAGGATGAATTTCGCTGCTTTATTGGGAATTTATCATGGTCAACATCAGATAGAGGATTGAAGCAGGCATTTGAGAAGTTTGGTCATCTGGTGGAGGCGAAGGTTG...

XM_057939496.1
AGGGTGCACATGTAATTTTGAATAATTCAGAGACGAAAAGGAGAATATAGGGTTTTTGGAAACGCTAAATCCTCAAACCAGAAGCTGCTCGTCGCTCCCACTCCAACGCCCAAATCGCAGCCGCGCAGTTTTATACACAGTGAATATGGGGGATCAGGATGAATTTCGCTGCTTTATTGGGAATTTATCATGGTCAACATCAGATAGAGGATTGAAGCAGGCATTTGAGAAGTTTGGTCATCTGGTGGAGGCGAAGGTTG...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC131011701
ATGGGGGATCAGGATGAATTTCGCTGCTTTATTGGGAATTTATCATGGTCAACATCAGATAGAGGATTGAAGCAGGCATTTGAGAAGTTTGGTCATCTGGTGGAGGCGAAGGTTGTGCTTGACAAGTTCTCTGGCCGCTCTCGTGGTTTTGGGTTCGTTTCATTTGAAGAAGAGAGGGATATGGAAGAAGCCATTAAAGCAATGAATGGAATGGATTTGGATGGGCGAGCCATTACTGTTGATAAAGCTCAACCTAACCA...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057795477.1
MGDQDEFRCFIGNLSWSTSDRGLKQAFEKFGHLVEAKVVLDKFSGRSRGFGFVSFEEERDMEEAIKAMNGMDLDGRAITVDKAQPNQGGRDRDGDRDQDRDRGRDRDRGRNRDSGGGRGSGGDCFKCGKPGHFARECPSGEGSRGGGGRYGGRDDKYGGSSRYGPDRNGDKYGGGSRRDSGRDSGRDSGRDSGSRGGSGSDKYSRDRSGPYERPASGSFRS

XP_057795478.1
MGDQDEFRCFIGNLSWSTSDRGLKQAFEKFGHLVEAKVVLDKFSGRSRGFGFVSFEEERDMEEAIKAMNGMDLDGRAITVDKAQPNQGGRDRDGDRDQDRDRGRDRDRGRNRDSGGGRGSGGDCFKCGKPGHFARECPSGEGSRGGGGRYGGRDDKYGGSSRYGPDRNGDKYGGGSRRDSGRDSGRDSGRDSGSRGGSGSDKYSRDRSGPYERPASGSFRS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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