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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002668`

染色体: Chr02 坐标: 46186925-46187875 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002668`
名称	SmilChr02G002668
描述	uncharacterized SmilChr02G002668
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	46186925 - 46187875 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009612`
GeneID	`131009612`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009612`
原始查询	`SmilChr02G002668`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827935]; symbol=AT4G00980; hit=AT4G00980; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827935]; symbol=AT4G00980; hit=AT4G00980; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G00980` (AT4G00980) zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827935] identity=25.4; qcov=0.976; evalue=8.43e-24; confidence=low
Rice	`Os08g0421700` - identity=24.1; qcov=0.856; evalue=9.06e-13; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009612

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793010.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057793010.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057793010.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793010.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793010.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:46187584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:46187684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B70,C62
`Chr2:46187684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793010.1

291 aa

146

291

Retrotran_gag_2

zf-CCHC

PF14223 Retrotran_gag_2 46-175 aa PF00098 zf-CCHC 236-251 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793010.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	46	175	1.6e-17	64.5	gag-polypeptide of LTR copia-type
`XP_057793010.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	236	251	2.5e-07	31.2	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937027.1
ATGGCGACAGGAAGCAACACCAACAACAACAATGCTCCACCAGTTCCGACCAACGTTCCACATGCTCCAGCACCTGCTGCTGCCGAAAAGCCGGAAAAATTCGCAGGTTCTGAATTTAAACGTTGGCAGTCTAAGATGCTGTTTTATCTTACTACATTGAATATGGCTCGTTTTGTGAATGAATCTCCTCCAACTGTGGGGGAAGACGAGACTGATTCGCAACTGCGGATAGCATATGATGCATGGCATCATAGCGACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009612
ATGGCGACAGGAAGCAACACCAACAACAACAATGCTCCACCAGTTCCGACCAACGTTCCACATGCTCCAGCACCTGCTGCTGCCGAAAAGCCGGAAAAATTCGCAGGTTCTGAATTTAAACGTTGGCAGTCTAAGATGCTGTTTTATCTTACTACATTGAATATGGCTCGTTTTGTGAATGAATCTCCTCCAACTGTGGGGGAAGACGAGACTGATTCGCAACTGCGGATAGCATATGATGCATGGCATCATAGCGACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793010.1
MATGSNTNNNNAPPVPTNVPHAPAPAAAEKPEKFAGSEFKRWQSKMLFYLTTLNMARFVNESPPTVGEDETDSQLRIAYDAWHHSDFLCRNYILNGLDNTLYNVYSSAKTSKELWDSLETKYKAEDAGLKKFIVGRFLDFKMVDSKTVVEQVQEFQLILHDILAEDMELSESFQMGLEDLIVRLRIEEDNRISENKTNKTSIEAKANLAESSNKKKRKFKGKHPDSKGQKRIKGDCFNCGKPGHMAKDCRKPKKDKHNGH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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