当前解析结果
SmilChr02G002675| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002675 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002675 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002675 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 46342933 - 46343594 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009615 |
|---|---|
| GeneID | 131009615 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009615 |
| 原始查询 | SmilChr02G002675 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0643433- identity=31.3; qcov=0.995; evalue=7.2e-18; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009615 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057793013.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057793013.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057793013.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793013.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793013.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:46342931 |
CTT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | D10 |
Chr2:46342954 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C11,C52,C74 |
Chr2:46342971 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B137 |
Chr2:46342986 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C33,C71 |
Chr2:46342987 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C75 |
Chr2:46343000 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 76 | A19,A20,A9,B100,B105,B110,B111,B114,B117,B119,B12,B122,B127,B130,B134,B136,B137,B138,B19,B22,B25,B26,B27,B30,B37,B44,B46,B49,B56,B60,B61,B63,B68,B74,B79,B81,B84,B85,B87,B88,B9,B90,B92,B93,B98,C11,C2,C21,C24,C26,C31,C32,C33,C34,C51,C52,C54,C57,C61,C64,C65,C66,C68,C69,C7,C71,C73,C75,C78,C8,C86,C87,C9,D5,D7,D8 |
Chr2:46343002 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 41 | A20,A9,B100,B105,B110,B117,B119,B122,B130,B137,B22,B26,B27,B30,B46,B56,B61,B63,B68,B84,B87,B88,B9,B98,C11,C21,C24,C33,C52,C57,C65,C66,C69,C71,C75,C78,C8,C86,C87,D7,D8 |
Chr2:46343025 |
T |
TGA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 6 | B100,B130,B27,C24,C52,C65 |
Chr2:46343027 |
AGT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B100,B130,B27,C24,C52,C65 |
Chr2:46343032 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B27,B88,C34,C86 |
Chr2:46343046 |
T |
TGA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C78 |
Chr2:46343046 |
T |
TGA |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | C78 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。