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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002680`

染色体: Chr02 坐标: 46384041-46387019 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002680`
名称	SmilChr02G002680
描述	transcription factor VIP1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	46384041 - 46387019 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011713`
GeneID	`131011713`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011713`
原始查询	`SmilChr02G002680`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor VIP1-like
产物	transcription factor VIP1-like
Arabidopsis	`AT1G43700` (VIP1) VIRE2-interacting protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840957] identity=44.3; qcov=1.07; evalue=7.63e-68; confidence=medium
Rice	`Os12g0162500` (OsbZIP84) - identity=56.4; qcov=0.86; evalue=9.37e-72; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00170 (bZIP_1); PF07716 (bZIP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011713

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795495.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795495.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795495.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795495.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795495.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:46384305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B108,B5
`Chr2:46384314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:46384350`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A11,A21,A6,B101,B110,B122,B16,B25,B28,B38,B39,B40,B44,B53,B59,B65,B69,B7,B78,B9,B97,C13,C16,C19,C42,C59,C84
`Chr2:46384392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr2:46384478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B118,C82,D4
`Chr2:46384637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr2:46384646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr2:46386581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B6,C63
`Chr2:46386784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:46386901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B89

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795495.1

293 aa

146

293

bZIP_2

bZIP_1

PF07716 bZIP_2 152-203 aa PF00170 bZIP_1 154-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795495.1`	Pfam	`PF07716`	bZIP_2	Coiled-coil	152	203	3e-07	31.1	Basic region leucine zipper
`XP_057795495.1`	Pfam	`PF00170`	bZIP_1	Coiled-coil	154	212	7.7e-09	36.3	bZIP transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939512.1
CTTCAACTAACTCCTTTCAACTAACCTCTTCTTCTCCACTGACAAAACCCCAATTCCCCCAAATTCCTCATCCCTAAATCCCATTCCTGCTCTTCTCGCTCTAACCAAAATGATGGACGTCGACCCCAAATTCGGCAAGCCCGCGTATAATCCGGGTCGGGCCGACCTGGACCAGATATCCGACGCTCCGGCCCGGGTGGCGTTCCACCGCCGGGCCCACTCGGAGACCTTCTTCCGCTTCCCAGACCTCGACGACATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011713
ATGATGGACGTCGACCCCAAATTCGGCAAGCCCGCGTATAATCCGGGTCGGGCCGACCTGGACCAGATATCCGACGCTCCGGCCCGGGTGGCGTTCCACCGCCGGGCCCACTCGGAGACCTTCTTCCGCTTCCCAGACCTCGACGACATCCTCGTCGACGGCGTCCTCGCTGACCTCAACCTCGAGACGCCGCCGTCTATGCACGCGGCGGCGCCGCCGCCTCAGCAGCAGCCGAAGAGGAGCGACGGGCTGGCGCACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795495.1
MMDVDPKFGKPAYNPGRADLDQISDAPARVAFHRRAHSETFFRFPDLDDILVDGVLADLNLETPPSMHAAAPPPQQQPKRSDGLAHLRSLSVDADFFEGLVLDGPPSAEAGPRHRHSNSMDGYSSTTSSCEVDSNAKKAIAADRLAELALIDPKRAKRILANRQSAARSKERKTRYTSELERKVQTLQSEATTLSAKITLLQRDTSGLTAENKELKLKLQAMEQQAHLRDALNEALRNELQWLKITAGQMHGSNGSSRGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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