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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002700`

染色体: Chr02 坐标: 46797249-46801737 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002700`
名称	SmilChr02G002700
描述	uncharacterized SmilChr02G002700
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	46797249 - 46801737 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011734`
GeneID	`131011734`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011734`
原始查询	`SmilChr02G002700`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838734]; symbol=AT1G21350; hit=AT1G21350; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838734]; symbol=AT1G21350; hit=AT1G21350; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G21350` (AT1G21350) Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838734] identity=79.5; qcov=0.796; evalue=3.96e-114; confidence=high
Rice	`Os07g0260300` (P0046D03.105) - identity=76.5; qcov=0.747; evalue=1.1e-104; confidence=high
GO	GO:0016209 (antioxidant activity); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00578 (AhpC-TSA); PF08534 (Redoxin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011734

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057795532.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057795532.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795532.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795532.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795532.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:46797554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr2:46798839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,B82,B87
`Chr2:46799658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:46799815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr2:46799832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:46801225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795532.1

251 aa

126

251

AhpC-TSA

Redoxin

PF00578 AhpC-TSA 71-190 aa PF08534 Redoxin 71-191 aa

XP_057795533.1

245 aa

122

245

AhpC-TSA

Redoxin

PF00578 AhpC-TSA 71-190 aa PF08534 Redoxin 71-191 aa

XP_057795534.1

245 aa

122

245

AhpC-TSA

Redoxin

PF00578 AhpC-TSA 71-190 aa PF08534 Redoxin 71-191 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795532.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	71	190	3.1e-14	53.7	AhpC/TSA family
`XP_057795532.1`	Pfam	`PF08534`	Redoxin	Domain	71	191	3.8e-14	53.4	Redoxin
`XP_057795533.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	71	190	2.9e-14	53.8	AhpC/TSA family
`XP_057795533.1`	Pfam	`PF08534`	Redoxin	Domain	71	191	3.6e-14	53.5	Redoxin
`XP_057795534.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	71	190	2.9e-14	53.8	AhpC/TSA family
`XP_057795534.1`	Pfam	`PF08534`	Redoxin	Domain	71	191	3.6e-14	53.5	Redoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009097099.1
CCTTGTCTTAGATAACGCGACTGGAAAAAAGAAGGAAAATCGGATTACCAGAATTTCGAAATTCCTATCGACTATGGCGGGTGTTCTAACGGTCGCCGCGTCATCAGCCGCCGTCTGTCGGCGCTCGTTTCCGGCGAAGAAATCTCTCTCTTCTTCTACTTCATCTTCGAAATGCTACTCGATCGGGGGCTGGGATCCCCTGCTTCGCAGGCCCACGGTGCTCCGCCCGAGAAAGCTCGTGATTCGAGCTGCCCGGACCG...

XR_009097098.1
CCTTGTCTTAGATAACGCGACTGGAAAAAAGAAGGAAAATCGGATTACCAGAATTTCGAAATTCCTATCGACTATGGCGGGTGTTCTAACGGTCGCCGCGTCATCAGCCGCCGTCTGTCGGCGCTCGTTTCCGGCGAAGAAATCTCTCTCTTCTTCTACTTCATCTTCGAAATGCTACTCGATCGGGGGCTGGGATCCCCTGCTTCGCAGGCCCACGGTGCTCCGCCCGAGAAAGCTCGTGATTCGAGCTGCCCGGACCG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131011734
ATGGCGGGTGTTCTAACGGTCGCCGCGTCATCAGCCGCCGTCTGTCGGCGCTCGTTTCCGGCGAAGAAATCTCTCTCTTCTTCTACTTCATCTTCGAAATGCTACTCGATCGGGGGCTGGGATCCCCTGCTTCGCAGGCCCACGGTGCTCCGCCCGAGAAAGCTCGTGATTCGAGCTGCCCGGACCGAGTCCAAAGGGGTTTCTCTTGGTTTCAGAGCACCAGATTTCGAGCTTCTGGAACCTCTCACTGGGAAAGTGTG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057795532.1
MAGVLTVAASSAAVCRRSFPAKKSLSSSTSSSKCYSIGGWDPLLRRPTVLRPRKLVIRAARTESKGVSLGFRAPDFELLEPLTGKVWKLDDFDSYPALLVMFICNHCPFVKHLKKDIVKLSNFYMKKGLAVVAISSNSVTTHPQDGPDVMAKEAKIFKYPFPYLYDESQDVARNFGAVCTPEFFLFKKDGRRPFELVYHGQFDDSRPSNNMRITGRDLSLAIDSVLSGQPVSSIQKPSVGCSIKWKPEVEP

XP_057795533.1
MAGVLTVAASSAAVCRRSFPAKKSLSSSTSSSKCYSIGGWDPLLRRPTVLRPRKLVIRAARTESKGVSLGFRAPDFELLEPLTGKVWKLDDFDSYPALLVMFICNHCPFVKHLKKDIVKLSNFYMKKGLAVVAISSNSVTTHPQDGPDVMAKEAKIFKYPFPYLYDESQDVARNFGAVCTPEFFLFKKDGRRPFELVYHGQFDDSRPSNNMRITGRDLSLAIDSVLSGQPVSSIQKPRMMVPCLP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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