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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002712`

染色体: Chr02 坐标: 46967811-46970940 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002712`
名称	SmilChr02G002712
描述	uncharacterized SmilChr02G002712
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	46967811 - 46970940 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011745`
GeneID	`131011745`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011745`
原始查询	`SmilChr02G002712`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Uncharacterized protein family UPF0090 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844048]; symbol=AT1G77122; hit=AT1G77122; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Uncharacterized protein family UPF0090 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844048]; symbol=AT1G77122; hit=AT1G77122; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G77122` (AT1G77122) Uncharacterized protein family UPF0090 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844048] identity=66.3; qcov=0.611; evalue=3.13e-83; confidence=high
Rice	`Os04g0438300` - identity=60.3; qcov=0.618; evalue=1.89e-78; confidence=high
GO	GO:0042274 (ribosomal small subunit biogenesis)
KEGG	-
Pfam	PF25498 (DUF7912)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011745

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057795556.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057795556.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795556.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795556.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795556.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:46968008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C43,D9
`Chr2:46968156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:46970648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,A7,B126
`Chr2:46970663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr2:46970679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr2:46970715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B113,B50,C18
`Chr2:46970733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B91,C51,D10,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795556.1

306 aa

153

306

DUF7912

PF25498 DUF7912 213-303 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795556.1`	Pfam	`PF25498`	DUF7912	Domain	213	303	1e-36	125.6	Domain of unknown function (DUF7912)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939573.1
GGGCCCTTAGCCCATTTAGGATGGGTGCCCATGTAACGGCATCGTTCTTGATGAGTCAAGATTGTCGATAAAAATCCATTCCCATCTTTCCTCAAACCAGCTTCCTCACAAGTTTAACTAAACTAACGATAATCTGGAGAAATCTACCCCTCGAAATGAACATAATTACCCCAAATTGCCATCATCCTGCGCGATTGCGCTCTGTTTCTTCAACAATTCCTGCTGCGCTGCGAGTATCACCTGCTATGGGTTTTAGTACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011745
ATGAACATAATTACCCCAAATTGCCATCATCCTGCGCGATTGCGCTCTGTTTCTTCAACAATTCCTGCTGCGCTGCGAGTATCACCTGCTATGGGTTTTAGTACTGCGTCTTTCCCGTTTTCTCCTTCCTCGTTTCGGAATATTCCTCAAATGCCCCTCGTTGCATTTGCAAAGAAGAAGAACTCTGACTCGGAGGCAGTTTTGAGTCCTTCCATTACTGAAGAAGTATTTATGGATGACGGCGTAGAAGACGACATTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795556.1
MNIITPNCHHPARLRSVSSTIPAALRVSPAMGFSTASFPFSPSSFRNIPQMPLVAFAKKKNSDSEAVLSPSITEEVFMDDGVEDDILLDDELLEDDGYFDDEYVEAEPSVGDGAGGGGILLAGTGWHKKALEIAEEVCLSFDGELDIYAFRTQLNATIQVRIERLTNKSGSPNMTDIEAFTTTYRTRLDEAGATGDIPQDISLEVSSPGVERVVRVPQDLERFKDRNLYVKYVAEATDMGSSSELDGIFRLISYDIESRC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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