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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002728`

染色体: Chr02 坐标: 47198814-47200452 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002728`
名称	SmilChr02G002728
描述	probable inorganic phosphate transporter 1-5
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	47198814 - 47200452 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011764`
GeneID	`131011764`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011764`
原始查询	`SmilChr02G002728`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable inorganic phosphate transporter 1-5
产物	probable inorganic phosphate transporter 1-5
Arabidopsis	`AT2G32830` (PHT1;5) phosphate transporter 1;5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817844] identity=69.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0564000` (PT6) - identity=70; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005315 (phosphate transmembrane transporter activity); GO:0006817 (phosphate ion transport); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00083 (Sugar_tr); PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011764

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057795582.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057795582.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795582.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795582.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795582.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:47198970`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B84
`Chr2:47198970`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B84
`Chr2:47199074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr2:47199083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:47199373`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C7
`Chr2:47199373`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C7
`Chr2:47199461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr2:47199465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:47199530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,C82,D7
`Chr2:47199625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,C85,D8
`Chr2:47199722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:47199787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795582.1

522 aa

261

522

Sugar_tr

MFS_1

PF00083 Sugar_tr 26-512 aa PF07690 MFS_1 65-453 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795582.1`	Pfam	`PF00083`	Sugar_tr	Family	26	512	4.6e-45	155.1	Sugar (and other) transporter
`XP_057795582.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	65	453	1.2e-26	94.1	Major Facilitator Superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939599.1
CAGCAGTTCGCCACCAAATACCAAATATCATAATCAGAGATATCTCTAATGGCGAGCAGCGGCGGCAGCGTTCTAGCGACGCTGGATTCATCGAAAACGCAATGGTACCACTACAAGGCGGTGATCGTCTCCGGCATGGGGTTCTTCACCGACGCCTACGACCTCTTCTGCATCTCCCTCCTCACCAAGCTCCTCGGCCGCATCTACTACCACGTCCCCTCCTCCCCCAAGCCCGGCGTCCTCCCGCCCTCCGTCGCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011764
ATGGCGAGCAGCGGCGGCAGCGTTCTAGCGACGCTGGATTCATCGAAAACGCAATGGTACCACTACAAGGCGGTGATCGTCTCCGGCATGGGGTTCTTCACCGACGCCTACGACCTCTTCTGCATCTCCCTCCTCACCAAGCTCCTCGGCCGCATCTACTACCACGTCCCCTCCTCCCCCAAGCCCGGCGTCCTCCCGCCCTCCGTCGCTGCCGCCGTCAACGGCGTCGCCCTCTGCGGCACCCTCCTCGGCCAGCTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795582.1
MASSGGSVLATLDSSKTQWYHYKAVIVSGMGFFTDAYDLFCISLLTKLLGRIYYHVPSSPKPGVLPPSVAAAVNGVALCGTLLGQLFFGLLGDRLGRKKVYGLTLVIMAFCSIASGLSFGSSPKSVMATLCFFRFWLGFGIGGDYPLSATIMAEYANKKTRGSFIAAVFAMQGFGILTGGLVGMAVSAAFRVCVAAPPYSVDPVGSTPPEADYVWRIVLMLGALPAVLSYYWRMKLPETARYTALVAKDTEKACRDMEKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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