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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002734`

染色体: Chr02 坐标: 47286408-47287168 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002734`
名称	SmilChr02G002734
描述	uncharacterized SmilChr02G002734
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	47286408 - 47287168 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009626`
GeneID	`131009626`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009626`
原始查询	`SmilChr02G002734`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=27.3; qcov=0.843; evalue=5.53e-12; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=26.8; qcov=0.912; evalue=4.25e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009626

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793022.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057793022.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057793022.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057793022.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793022.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:47286618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B102,B123,B130,B132,B139,B26,B62,B95
`Chr2:47286642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	183	A1,A10,A11,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A23,A3,A4,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B102,B103,B105,B106,B107,B109,B11,B112,B113,B115,B117,B118,B119,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B137,B139,B14,B140,B16,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B29,B31,B32,B33,B34,B36,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B44,B45,B47,B5,B50,B52,B53,B54,B55,B56,B59,B6,B62,B64,B66,B67,B68,B69,B70,B71,B73,B74,B75,B76,B78,B80,B83,B86,B87,B9,B91,B94,B95,B96,B97,B99,C1,C10,C11,C13,C14,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C31,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C41,C45,C46,C49,C5,C50,C52,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D9
`Chr2:47286647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B92,C69
`Chr2:47286655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B32,C6
`Chr2:47286657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:47286659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:47286684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B40,C87
`Chr2:47286698`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	75	A1,A10,A16,A20,A3,A8,B100,B111,B112,B114,B117,B122,B124,B128,B129,B15,B17,B18,B19,B22,B24,B29,B3,B37,B4,B40,B44,B53,B56,B69,B72,B75,B77,B79,B8,B82,B85,B86,B96,B98,C12,C18,C21,C26,C27,C28,C30,C34,C35,C44,C48,C50,C52,C53,C55,C59,C6,C61,C64,C68,C69,C73,C75,C76,C77,C8,C81,C83,C84,C85,C86,C9,D11,D7,D9
`Chr2:47286718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,C12
`Chr2:47286729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B40
`Chr2:47286752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C57
`Chr2:47286754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B33,B93,C12,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793022.1

217 aa

108

217

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 42-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793022.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	42	135	5.1e-16	59.8	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937039.1
ATGGAGTTGTTTGATAGGGAGCTAGGGATGACTAATGCCTTACTTGAGTTCATCTCTGTTTGTACCCCAAATGCAGGAAAGATGGACGTGTGGAGGTGGAAGAAGACCAAGAGTGGAGAGCTGTCAACCAAATCAGTGTATGAAGTGTTGATGCAGAATAGAAATCTAACGGCTCCAGTTCTACACTCAAATGCGATGATGGCAAAGGTTTGGAGTGCACCGACCCCACACAAGGTGAGAGTGACAGCATGGCGGTGTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009626
ATGGAGTTGTTTGATAGGGAGCTAGGGATGACTAATGCCTTACTTGAGTTCATCTCTGTTTGTACCCCAAATGCAGGAAAGATGGACGTGTGGAGGTGGAAGAAGACCAAGAGTGGAGAGCTGTCAACCAAATCAGTGTATGAAGTGTTGATGCAGAATAGAAATCTAACGGCTCCAGTTCTACACTCAAATGCGATGATGGCAAAGGTTTGGAGTGCACCGACCCCACACAAGGTGAGAGTGACAGCATGGCGGTGTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793022.1
MELFDRELGMTNALLEFISVCTPNAGKMDVWRWKKTKSGELSTKSVYEVLMQNRNLTAPVLHSNAMMAKVWSAPTPHKVRVTAWRCLKNRLATYGNLVKRRVQLADVEVWCNACVGNVETANHLFLLCPKAQQVWNAIESWMGIRTARPKELMQHFNMFINSGRGRESEKALKALWMCTIWLLWKQRNESRFEEQVWEVQRAVSEIKGTSGTFCFYG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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