Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002737`

染色体: Chr02 坐标: 47304430-47306172 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002737`
名称	SmilChr02G002737
描述	uncharacterized SmilChr02G002737
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	47304430 - 47306172 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011772`
GeneID	`131011772`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011772`
原始查询	`SmilChr02G002737`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815895]; symbol=AT2G14095; hit=AT2G14095; species=arabidopsis; confidence=low
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815895]; symbol=AT2G14095; hit=AT2G14095; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G14095` (AT2G14095) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815895] identity=30.1; qcov=0.73; evalue=8.16e-15; confidence=low
Rice	`Os08g0483600` (OJ1111_H02.21-1) - identity=32.8; qcov=0.607; evalue=5.94e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011772

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057795595.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.60000	`XP_057795595.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057795595.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795595.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795595.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:47304937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B32,C6
`Chr2:47305265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B93,B94,C36
`Chr2:47305448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr2:47305485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr2:47305861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B17,B93,B94,C36
`Chr2:47305903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B9
`Chr2:47305920`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B3,B31,B58,C64,C66
`Chr2:47305920`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B3,B31,B58,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939612.1
TATGATATTATTAATTCGTTGTCCTATATTTTCTACAGAAAATAAATAAATTAACGGTGAGAAGTCAAATCCTCACAGAAGGTAGAAAAAAAGAAATTTTCAACAAATTAATTACCTCTTCTTCTTTATTATTATTCCCTTCAACAATATTAAGCGCGTTTACCAATTAACCAGCATTTCTTGGAAACTCATATTCCTACGTTTATTTGTATATACAGTGCACGCATTTCCTTCTCGGTAACTATTTCTTGCCATTTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011772
ATGTCGTCTGCGACAAGATTCATCAAATTGATTTCAAGATTTTCTTCTCAATATCCGGCGTCGAATATATCACAGCTCAGGCATCATGGCATATCTCAGAACTCCGGTTATCGGTATCTTAACAACTACACAAGAATGCAGATGTCTAACACACACAAAAGAAATTTGTCTGTAAATAGTGGTGGTGGTGTTCAACCAAGTGCTCCATTACCTCCATCTTCATACTGGAAGTGGATTCTTGGATTAGTGGTTTCAATTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795595.1
MSSATRFIKLISRFSSQYPASNISQLRHHGISQNSGYRYLNNYTRMQMSNTHKRNLSVNSGGGVQPSAPLPPSSYWKWILGLVVSIIVPSTSSTWGPFLQLKNDVDTAVETLEGIVEVVEKAAEIVDKVAEEISDDLPEGRKLKKVLEVLEDAAEATARDAHTVGDAIDKFQEVEEKIENIMGKSSEAIDESPKGE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器