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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002752`

染色体: Chr02 坐标: 47542130-47545017 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002752`
名称	SmilChr02G002752
描述	F-box protein SKP2A-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	47542130 - 47545017 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011782`
GeneID	`131011782`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011782`
原始查询	`SmilChr02G002752`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein SKP2A-like
产物	F-box protein SKP2A-like
Arabidopsis	`AT1G21410` (SKP2A) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838740] identity=73.1; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0425700` (OsFbox258) - identity=67.9; qcov=0.992; evalue=2.49e-179; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0019005 (SCF ubiquitin ligase complex); GO:0031146 (SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like); PF13516 (LRR_6); PF25372 (LRR_FBXL15); PF29594 (LRR_SKP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011782

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057795605.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057795605.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057795605.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057795605.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795605.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:47542387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr2:47542389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C2,C27,C32,C68
`Chr2:47542395`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C57
`Chr2:47542395`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C57
`Chr2:47542458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C2,C27,C32,C68
`Chr2:47542581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:47542626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:47543226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B15,C37,C39,C78
`Chr2:47543292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:47543293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:47543456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,B71
`Chr2:47544292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795605.1

368 aa

184

368

F-box-like

F-box

LRR_FBXL15

LRR_SKP2

LRR_6

PF12937 F-box-like 42-76 aa PF00646 F-box 42-77 aa PF25372 LRR_FBXL15 156-315 aa PF29594 LRR_SKP2 157-298 aa PF13516 LRR_6 209-232 aa PF13516 LRR_6 235-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795605.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	42	76	3.5e-06	27.4	F-box-like
`XP_057795605.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	42	77	1.6e-05	25.3	F-box domain
`XP_057795605.1`	Pfam	`PF25372`	LRR_FBXL15	Repeat	156	315	4.3e-18	65.7	F-box/LRR-repeat protein 15, leucine rich repeat domain
`XP_057795605.1`	Pfam	`PF29594`	LRR_SKP2	Repeat	157	298	2e-24	87.0	SKP2 LRR domain
`XP_057795605.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	209	232	4.5e-15	55.1	Leucine Rich repeat
`XP_057795605.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	235	258	4.5e-15	55.1	Leucine Rich repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939622.1
AATGAAAGTGTTAATTCAATGTGAGTAGATTTTTGCAATGAAACGTATCTGTTGACATGACACGTGGCCAATCACTCATCGGCCTATTTTTTCTTCTTTGTGCTATTCATCTGTCTCTCTCGCTCTAAAAATTTTAAAGACCACAGCTTATAAGGTTTGACAAAGGCAAAATCCTCACATCATCCAAAACCTCCGAGATTGAAAGGCTGCGACTTGAGAGGGATGAAAGAGACGGAGGGTCTGAATTCGAGCTTTGAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011782
ATGAAAGAGACGGAGGGTCTGAATTCGAGCTTTGAGAAATTGATGGTTTTCGGTGTTGCTGAGAGCATGAGTGGTGGTGGTGGGATGGGGGGTGGTTTGGGTGGGGGTGCGAGGATAACTGAGTGGAAGGATATTCCAGTAGAGCTGTTGTTCAGGATTTTGTCTCTGGTGGATGATCAGACGGTGATTGTGGCTTCTGGGGTTTGCCATGGATGGAGGGATGCAGTTTCTTGGGGCCTTACCCATCTTTCTCTCTCTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795605.1
MKETEGLNSSFEKLMVFGVAESMSGGGGMGGGLGGGARITEWKDIPVELLFRILSLVDDQTVIVASGVCHGWRDAVSWGLTHLSLSWCKKNMNNLVLSLAPKFTKLQGIVLRQDTPQLQDDAVEKIAAHCHELQELDLSKSFRLTDRSLYALAHGCPELVKLNISGCTAFSDTALGYLTSFCRKLKTLNLCGCVRTATDRALKAIAYNCHQMQSLNLGWCDRVGDEGVKSLAYGCPNLRALDLCGCLLITDESVVALANN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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