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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002757`

染色体: Chr02 坐标: 47612295-47615093 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002757`
名称	SmilChr02G002757
描述	uncharacterized SmilChr02G002757
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	47612295 - 47615093 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011788`
GeneID	`131011788`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011788`
原始查询	`SmilChr02G002757`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=32; qcov=0.965; evalue=3.25e-29; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=33.5; qcov=1; evalue=2.73e-34; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011788

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057795608.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057795608.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795608.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795608.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795608.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:47612566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B118,C33,C82,D4
`Chr2:47612576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr2:47612578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,D11
`Chr2:47612593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr2:47612615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr2:47612618`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A11,A19,A20,B12,B121,B137,B18,B22,B23,B29,B47,B52,B55,B6,B66,B86,B87,C24,C3,C31,C41,C46,C49,C50,C52,C56,C67,C73,C79
`Chr2:47612741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A13,A14,A20,B108,B79,B84,C12,C23,C36,C43,C57,C71,C74
`Chr2:47612774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr2:47612824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,C33,C82,D4
`Chr2:47612923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:47612925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr2:47613162`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	104	A1,A10,A13,A14,A16,A18,A20,A22,A7,A9,B1,B102,B103,B106,B107,B108,B110,B111,B112,B114,B115,B118,B119,B122,B124,B126,B127,B128,B131,B133,B134,B138,B16,B20,B23,B27,B3,B32,B34,B36,B38,B39,B4,B44,B55,B57,B59,B61,B62,B66,B69,B7,B73,B79,B82,B84,B85,B87,B88,B89,B94,C1,C11,C12,C13,C14,C15,C17,C21,C23,C24,C25,C29,C30,C31,C33,C36,C41,C43,C46,C48,C50,C51,C52,C53,C57,C59,C6,C62,C63,C64,C66,C69,C71,C74,C77,C80,C82,C83,C84,C87,D1,D4,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795608.1

227 aa

114

227

DBD_Tnp_Mut

PF03108 DBD_Tnp_Mut 2-57 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795608.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	2	57	3.1e-06	27.5	MuDR family transposase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939625.1
TAGAAGGGCAGGTTAGATTTGATGAAGGTAGGGAGGCTGGATTAGAAGATGATAATGGTATAGGAGCTGATTTAGTGGGAAGTGAAGATGAGGGTGATGATAGTGGTCACACAATTACTGACTCTAGCACATATAGTGATATCCAGTCAAATAGTGATGAGGAAGTAGTGAAGCATGATCATGTGGTTGACTCTATTGCTGAGGGAGATCAAGGATACTTCGCATTAGGTATGACCTTTGCAGGGGCAAAGGATGCTGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011788
ATGACCTTTGCAGGGGCAAAGGATGCTGTGGAGTCCATTAACAACTATGCTGTCAAATTTGGTTACAAGATCAAGTTTGTTAAAAATGAACCTCATAGAATCAGGGTGGTTTGCATCAGTGAAAGAAATTGTCCATTTGTAATGCTTGCTTCAAAGGGTAGGGAGTCAGAGGGCTTGGTTATTAACACATTAACACTAGAGCATACCTGTTGTAGGCAAATAGAGGTGCCTAGTACTTCTAAAAAATGCCTAGCTAACTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795608.1
MTFAGAKDAVESINNYAVKFGYKIKFVKNEPHRIRVVCISERNCPFVMLASKGRESEGLVINTLTLEHTCCRQIEVPSTSKKCLANYFKEALYRNPRFSSKDMQGHVKDHLKLHVSLGKCKRAKRTILAKLQGSYKEKFNMLVGYIEKVKETNPGSKIELQLSKDELANGMRVFKRLFVMLDACKKNWIGGCRPLISLDSCHLKGVTFGVLLTAVGNDANDGVVPIA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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