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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002765`

染色体: Chr02 坐标: 47711545-47712111 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002765`
名称	SmilChr02G002765
描述	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2 B, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	47711545 - 47712111 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009635`
GeneID	`131009635`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009635`
原始查询	`SmilChr02G002765`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2 B, chloroplastic-like
产物	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2 B%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`ATCG00890` (ndhB) - identity=96.3; qcov=0.723; evalue=1.26e-91; confidence=high
Rice	`gene-ndhB` - identity=94.8; qcov=0.723; evalue=2.25e-91; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00361 (Proton_antipo_M)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009635

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057793031.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.60000	`XP_057793031.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057793031.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057793031.1`
5	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057793031.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:47711559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B126,B21,C50,C69
`Chr2:47711573`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B104,B126,B13,B21,C50,C69
`Chr2:47711609`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B126,B13,B21,C69
`Chr2:47711609`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B126,B13,B21,C69
`Chr2:47711614`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B126,B13,B21,C69
`Chr2:47711614`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B126,B13,B21,C69
`Chr2:47711618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B13,B21,C69
`Chr2:47711621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B13,B21,C69
`Chr2:47711629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B13,B21,C69
`Chr2:47711739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:47711771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B54,B80,C44
`Chr2:47711847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A2,A7,B126

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793031.1

188 aa

188

Proton_antipo_M

PF00361 Proton_antipo_M 23-136 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793031.1`	Pfam	`PF00361`	Proton_antipo_M	Domain	23	136	1.4e-29	103.9	NADH:quinone oxidoreductase/Mrp antiporter, TM

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937048.1
ATGGCTATAACAGAGTTTCTCTTATTCGTATTAACAGCTACTCTAGGAGGAATGTTTTTATGTGGTGCTAACGATTTAATAACTATCTTTGTAGCTCCAGAATGTTTCAGTTTATGCTCCTACCTATTATCTGGATATACCAAGAAAGATGTACGGTCTAATGAGGCTACTATGAAATATTTACTCATGGGTGGGGCAAGCTCTTCTATTCTGGTTCATGGTTTCTCTTGGCTATATGGTTTATCCGGGGGAGAGATCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009635
ATGGCTATAACAGAGTTTCTCTTATTCGTATTAACAGCTACTCTAGGAGGAATGTTTTTATGTGGTGCTAACGATTTAATAACTATCTTTGTAGCTCCAGAATGTTTCAGTTTATGCTCCTACCTATTATCTGGATATACCAAGAAAGATGTACGGTCTAATGAGGCTACTATGAAATATTTACTCATGGGTGGGGCAAGCTCTTCTATTCTGGTTCATGGTTTCTCTTGGCTATATGGTTTATCCGGGGGAGAGATCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793031.1
MAITEFLLFVLTATLGGMFLCGANDLITIFVAPECFSLCSYLLSGYTKKDVRSNEATMKYLLMGGASSSILVHGFSWLYGLSGGEIELQEIVNGLINTQMYNSPGISIALIFITVGIGFKLSPAPSHQWTPDIYEGVRFVREIPSSLIFQNSMDMQKRNAIPTRTKTELLLVQITIKVKQGQGRPISL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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