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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002766`

染色体: Chr02 坐标: 47715788-47725114 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002766`
名称	SmilChr02G002766
描述	uncharacterized SmilChr02G002766
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	47715788 - 47725114 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009636`
GeneID	`131009636`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009636`
原始查询	`SmilChr02G002766`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hyccin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836530]; symbol=AT5G64090; hit=AT5G64090; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	hyccin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836530]; symbol=AT5G64090; hit=AT5G64090; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G64090` (AT5G64090) hyccin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836530] identity=35.2; qcov=0.948; evalue=2.07e-25; confidence=medium
Rice	`Os11g0169600` - identity=40.7; qcov=0.434; evalue=8.66e-12; confidence=low
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0046854 (phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process); GO:0072659 (protein localization to plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF09790 (Hyccin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009636

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057793032.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793032.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793032.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793032.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793032.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:47715792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C38
`Chr2:47715793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B82
`Chr2:47715862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr2:47715876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,C6
`Chr2:47715963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B51
`Chr2:47716034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C48
`Chr2:47716040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B15,B4,C37,C78
`Chr2:47724594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B24
`Chr2:47724607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B133,B26,B80,C48
`Chr2:47724610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A6,B5,B93,C1,C63
`Chr2:47724610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B5,B93,C1,C63
`Chr2:47724627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B43,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793032.1

249 aa

124

249

Hyccin

PF09790 Hyccin 140-190 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793032.1`	Pfam	`PF09790`	Hyccin	Repeat	140	190	7.8e-12	45.6	Hyccin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937049.1
ATGACGCACACACACAACCACAAAGAACCACGATGGAGCGTTGCTCTCGTTGGCTCGTCAATAGCCCAACAAACCTTTCACGCCCTCTCTGGTAATAACTCCACAAAGGATGAATCACAAAATTGCAGCAAACACAAAGGTGAAGGTCACAAAGCTATCTCTTCAGCTTCACTTGCTCTTCTCGCTGCTATGAAACTGATGGCAGAGTCGGGGATTCTAATCCCTAAGAAAAGCCATAGAAGGAAAGAGTTTGGAAATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009636
ATGACGCACACACACAACCACAAAGAACCACGATGGAGCGTTGCTCTCGTTGGCTCGTCAATAGCCCAACAAACCTTTCACGCCCTCTCTGGTAATAACTCCACAAAGGATGAATCACAAAATTGCAGCAAACACAAAGGTGAAGGTCACAAAGCTATCTCTTCAGCTTCACTTGCTCTTCTCGCTGCTATGAAACTGATGGCAGAGTCGGGGATTCTAATCCCTAAGAAAAGCCATAGAAGGAAAGAGTTTGGAAATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793032.1
MTHTHNHKEPRWSVALVGSSIAQQTFHALSGNNSTKDESQNCSKHKGEGHKAISSASLALLAAMKLMAESGILIPKKSHRRKEFGNERVSPSSLPRRHRPPRLLPSHLLRRLLLPLCGLSAASSGSANVSLCQWLYDTYLSGFEAVLLALYTSETKARNGKAVTVSIPDLSQPSLYHAPRNPNKFSSPHSNPRPSIGVLRCRSWSKLDFCKFASVWASVDCPCTSDFDGKPKSFAEKNEGRWSENGFGG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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