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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002768`

染色体: Chr02 坐标: 47744331-47750293 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002768`
名称	SmilChr02G002768
描述	TOM1-like protein 4
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	47744331 - 47750293 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011796`
GeneID	`131011796`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011796`
原始查询	`SmilChr02G002768`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TOM1-like protein 4
产物	TOM1-like protein 4
Arabidopsis	`AT1G21380` (AT1G21380) Target of Myb protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838737] identity=53.8; qcov=1; evalue=3.02e-172; confidence=high
Rice	`Os11g0199700` - identity=53.9; qcov=1.14; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0035091 (phosphatidylinositol binding); GO:0043130 (ubiquitin binding); GO:0043328 (protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway)
KEGG	-
Pfam	PF00790 (VHS); PF03127 (GAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011796

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057795623.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057795623.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057795623.1`
4	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.60000	`XP_057795623.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057795623.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:47746366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C62
`Chr2:47746385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:47749452`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C11
`Chr2:47749452`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795623.1

521 aa

260

521

VHS

GAT

PF00790 VHS 9-115 aa PF03127 GAT 195-268 aa

XP_057795624.1

521 aa

260

521

VHS

GAT

PF00790 VHS 9-115 aa PF03127 GAT 195-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795623.1`	Pfam	`PF00790`	VHS	Repeat	9	115	4.6e-30	105.1	VHS domain
`XP_057795623.1`	Pfam	`PF03127`	GAT	Domain	195	268	1.2e-19	71.0	GAT domain
`XP_057795624.1`	Pfam	`PF00790`	VHS	Repeat	9	115	4.6e-30	105.1	VHS domain
`XP_057795624.1`	Pfam	`PF03127`	GAT	Domain	195	268	1.2e-19	71.0	GAT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939640.1
TCATTGACCAATAGTACTAGCTCAATTCTTTAAATTTTTTTTTTTTTGAGGTATTGTTAAGCGCAATTAGGCAAATGATCAAAGCCTCCTCCTTTTCGTAATTTTTTTTAGTTGGGAAATGGTTTTTATTTATCTATTTTGCCAAACGCGGCCTTAGCAAGATATTCTGTGCAAAATTTTCATTTTTCTAGAGCTGTGACATAAGGTTCAAAGGTTGAAACTTCGACACACGCATTGCTCGCGCAAGATCCCACAAAACA...

XM_057939641.1
TTTTGAGGTATTGTTAAGCGCAATTAGGCAAATGATCAAAGCCTCCTCCTTTTCGTAATTTTTTTTAGTTGGGAAATGGTTTTTATTTATCTATTTTGCCAAACGCGGCCTTAGCAAGATATTCTGTGCAAAATTTTCATTTTTCTAGAGCTGTGACATAAGGTTCAAAGGTTGAAACTTCGACACACGCATTGCTCGCGCAAGATCCCACAAAACACGCACTGATAATTCATAATTCTTCAAGCACAGGCACAGCACAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011796
ATGGCGAATGCGGCAGCTTTTGCTGAGAGGGCTACTAGTGATTTGCTGATTGGTCCAGATTGGGCAGTGAATATAGAGCTATGCGATTTAATAAACATGGATCCTGGGCAAGCCAAGGATGCGTTGAAGACACTCAAGAAAAAATTAGCGAACAAAAGCCCTAAAATACAGCTCCTTGCGCTGTTTGTACTGGAGACTCTAAGCAAAAATTGTGGGGAACACGTGTTTCAACAGATCGCTGAGCGGGATATCTTGCACGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057795623.1
MANAAAFAERATSDLLIGPDWAVNIELCDLINMDPGQAKDALKTLKKKLANKSPKIQLLALFVLETLSKNCGEHVFQQIAERDILHDMVKIVRKKPDLNVREKILTLIDTWQEALGGAGGRFPQYFAAYNELKSAGVDFPPREENSVPLFTPPQTHPIVQLQPTSPYEEVAVQASLESDASGLSLPEIQNAEGIVDVLMEMLTALDPNNPQGLKDEIIVDLIDQCRSYQKRVMVLVNNTVDEDLLCKGLALNDNLQRVVS...

XP_057795624.1
MANAAAFAERATSDLLIGPDWAVNIELCDLINMDPGQAKDALKTLKKKLANKSPKIQLLALFVLETLSKNCGEHVFQQIAERDILHDMVKIVRKKPDLNVREKILTLIDTWQEALGGAGGRFPQYFAAYNELKSAGVDFPPREENSVPLFTPPQTHPIVQLQPTSPYEEVAVQASLESDASGLSLPEIQNAEGIVDVLMEMLTALDPNNPQGLKDEIIVDLIDQCRSYQKRVMVLVNNTVDEDLLCKGLALNDNLQRVVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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