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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002769`

染色体: Chr02 坐标: 47750368-47752149 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002769`
名称	SmilChr02G002769
描述	magnesium dechelatase SGRL, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	47750368 - 47752149 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011797`
GeneID	`131011797`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011797`
原始查询	`SmilChr02G002769`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	magnesium dechelatase SGRL, chloroplastic
产物	magnesium dechelatase SGRL%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G44000` (AT1G44000) STAY-GREEN-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841000] identity=61.1; qcov=0.883; evalue=1.03e-80; confidence=high
Rice	`Os04g0692600` - identity=46.7; qcov=0.895; evalue=8.41e-56; confidence=high
GO	-
KEGG	smil00860 (Porphyrin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF12638 (Staygreen)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011797

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057795625.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057795625.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.60000	`XP_057795625.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795625.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795625.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:47750575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:47750621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:47750899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr2:47751005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr2:47751131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B41,C12,C74
`Chr2:47751367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:47751916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B18,B26,B77,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795625.1

239 aa

120

239

Staygreen

PF12638 Staygreen 49-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795625.1`	Pfam	`PF12638`	Staygreen	Domain	49	198	5e-56	189.4	Staygreen protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939642.1
TCCATTTTCTTTCCAATGTGTTTTCATCATGTCCACAACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGATTTTGACAAGCACACACAGCACACGTTGAGTTGAGGAGAAATATTGGTGGTGGAGTGTGGAGAGGGAAAACTGGAGAGAAATGAGAAACAAGTAATACAACACAACAAAGAGAATGGCTGCTGCATTCTCACCTTGTTATATTCATAACTGCAAAATCAATCATACTTCACCCCCTTCTGCTCTGCTGCCTCACTCATTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011797
ATGGCTGCTGCATTCTCACCTTGTTATATTCATAACTGCAAAATCAATCATACTTCACCCCCTTCTGCTCTGCTGCCTCACTCATTGACTCCATCTTACAATTCTCTTGTTTTCCAGGCTGCAAGGCTATTAGGCCCTCCAGTAAGATTTGAAGCATCCAAGCTGAAAGTGCAGTTTGTAGGGGAAGAAGTGAGCAAGCAAACCAGAGTGGTGCCCAGAACCTACACTCTCTCCCACTGTGACTTCACTGCTCATCTTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795625.1
MAAAFSPCYIHNCKINHTSPPSALLPHSLTPSYNSLVFQAARLLGPPVRFEASKLKVQFVGEEVSKQTRVVPRTYTLSHCDFTAHLTLTISNIIPRDQLKGWYSKDDVVAEWTNVNGELFLNIHCYVSGPNPLSAMAAELRYLIFSKELPLVLEAVLYGDTEFFREHQQLMDALVRVYFHSSSNKYNRMECWGPLKDAALGKGVDMINGYSYASKETSRAPKFWGSPKSIFQALVTFLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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