当前解析结果
SmilChr02G002775| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002775 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002775 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002775 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 47814508 - 47817471 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131011804 |
|---|---|
| GeneID | 131011804 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011804 |
| 原始查询 | SmilChr02G002775 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011804 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.80000 | XP_057795633.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057795634.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057795633.1 |
| 4 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.40000 | XP_057795633.1 |
| 5 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.40000 | XP_057795633.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:47815894 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B119,B19 |
Chr2:47815940 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D8 |
Chr2:47816020 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C30,C40 |
Chr2:47816070 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B5 |
Chr2:47816070 |
TA |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B5 |
Chr2:47816113 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A5,B15,B4,C37,C78 |
Chr2:47816120 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B34 |
Chr2:47816129 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B34,C51 |
Chr2:47816129 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B34,C51 |
Chr2:47816148 |
TG |
* |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | B128,B31,B48,C40,C5 |
Chr2:47816183 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B109,C34 |
Chr2:47816183 |
G |
GT |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B109,C34 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。