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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002780`

染色体: Chr02 坐标: 47892862-47899489 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002780`
名称	SmilChr02G002780
描述	UDP-sugar pyrophosphorylase
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	47892862 - 47899489 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011810`
GeneID	`131011810`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011810`
原始查询	`SmilChr02G002780`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UDP-sugar pyrophosphorylase
产物	UDP-sugar pyrophosphorylase
Arabidopsis	`AT5G52560` (USP) UDP-sugar pyrophosphorylase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835333] identity=77.7; qcov=0.968; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0701200` (USP) - identity=76.5; qcov=0.952; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003977 (UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase activity); GO:0006048 (UDP-N-acetylglucosamine biosynthetic process)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00052 (Galactose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00053 (Ascorbate and aldarate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00541 (Biosynthesis of various nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01250 (Biosynthesis of nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01704 (UDPGP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011810

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057795641.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057795641.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795641.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795641.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795641.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:47894083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:47894572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:47894941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C85
`Chr2:47895759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:47897772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C85
`Chr2:47897908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C87
`Chr2:47897953`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A23,B3,B48,B97,B98,C30,C32,C45,C59,D5
`Chr2:47898633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B124,C48,C87,D10
`Chr2:47898761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr2:47899151`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	30	B10,B113,B115,B17,B18,B26,B28,B32,B48,B51,B67,B8,B84,B88,B93,C1,C13,C15,C19,C2,C28,C32,C45,C59,C68,C70,C77,C79,C8,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795641.1

622 aa

311

622

UDPGP

PF01704 UDPGP 131-286 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795641.1`	Pfam	`PF01704`	UDPGP	Family	131	286	3.3e-16	59.8	UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939658.1
ATTTTTAGTAAAAGTTAAATATACATGATTCTAGTAGAGGTTAATAATGTTCGAAACCGACCCGACCCGACCCGGACCGATTCGATTCGCGTCTCCGTGAGTAACTAACTCTCCGCCTGTCTTCTAAATCTGTATATACAAACACTACTCTCTCTGTTTTAGCATAGTACTCTTCGCATCATCTTATCCCACCGGAATCTGACGTCATGGCCACCGCTGCCGCGGCCGCGCTTTCCAAACTCTCCATAGATGATTTGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011810
ATGGCCACCGCTGCCGCGGCCGCGCTTTCCAAACTCTCCATAGATGATTTGGCCTCCGCCGCCCCCAATCTCCACAAAAATCTCTCCCTCCTCTCGCCTGAACAGGTGGAGTTGGCGAAGATGCTGTTGGATTTGAATCAGGCTCACTTGTTCGAGCATTGGCCCGAGCCCGGGGTTGACGATGATGACAAGCGTGCGTTCTTCGAACAGGTTTCTCGTCTTAATGCAAGTTACCCTGGTGGCCTAGCCTCTTACATCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795641.1
MATAAAAALSKLSIDDLASAAPNLHKNLSLLSPEQVELAKMLLDLNQAHLFEHWPEPGVDDDDKRAFFEQVSRLNASYPGGLASYIKTARELLADSKAGKNPYDGFSPSVPSGEILTFGDENFIQFENAGVREARKAAFVLVAGGLGERLGYNGIKVALPLESTTGTCFLQHYIESILALQEASCRLGEGEGPTEIPLAIMTSDDTHSRTTKLLETNDYFGMKPSQVKLLKQEKVACLDDNDARLAVDPNNKFKIQTKPH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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