当前解析结果
SmilChr02G002783| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002783 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002783 |
| 描述 | glycine-rich cell wall structural protein 2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 47911401 - 47911772 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009637 |
|---|---|
| GeneID | 131009637 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009637 |
| 原始查询 | SmilChr02G002783 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | glycine-rich cell wall structural protein 2-like |
| 产物 | glycine-rich cell wall structural protein 2-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009637 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057793033.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057793033.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793033.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793033.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057793033.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:47911402 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B95,C14 |
Chr2:47911420 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr2:47911426 |
T |
TCC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 15 | B106,B16,B17,B38,B39,B48,B63,B73,B90,B97,C13,C20,C81,C84,D6 |
Chr2:47911473 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
Chr2:47911475 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B109,D3 |
Chr2:47911490 |
TCG |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 17 | A16,A8,B105,B111,B139,B4,B42,B43,B75,B86,B97,B99,C28,C30,C35,C71,C75 |
Chr2:47911496 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B109 |
Chr2:47911513 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B109,B93 |
Chr2:47911522 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C85 |
Chr2:47911540 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B109,B93 |
Chr2:47911544 |
C |
CTT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 5 | A2,B126,C17,C82,D4 |
Chr2:47911544 |
C |
CTT |
2bp_insertion | CDS_variant | 5 | A2,B126,C17,C82,D4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。