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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002799`

染色体: Chr02 坐标: 48085014-48092014 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002799`
名称	SmilChr02G002799
描述	ubinuclein-1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	48085014 - 48092014 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011830`
GeneID	`131011830`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011830`
原始查询	`SmilChr02G002799`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubinuclein-1-like
产物	ubinuclein-1-like
Arabidopsis	`AT1G21610` (AT1G21610) wound-responsive family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838762] identity=41.7; qcov=0.829; evalue=5.69e-116; confidence=medium
Rice	`Os01g0883200` - identity=46.3; qcov=0.361; evalue=3.29e-59; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF08729 (HUN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011830

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795680.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057795680.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795680.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795680.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795680.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:48085449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C5
`Chr2:48086297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr2:48087208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C7
`Chr2:48087309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr2:48087449`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B102,C7
`Chr2:48087449`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B102,C7
`Chr2:48087455`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B102,C7
`Chr2:48087455`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B102,C7
`Chr2:48089608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B132,D2
`Chr2:48089615`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A9,B132,D2
`Chr2:48089615`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A9,B132,D2
`Chr2:48089619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B132,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795680.1

758 aa

379

758

HUN

PF08729 HUN 132-177 aa

XP_057795681.1

753 aa

376

753

HUN

PF08729 HUN 132-177 aa

XP_057795682.1

750 aa

375

750

HUN

PF08729 HUN 132-177 aa

XP_057795683.1

745 aa

372

745

HUN

PF08729 HUN 132-177 aa

XP_057795684.1

742 aa

371

742

HUN

PF08729 HUN 132-177 aa

XP_057795685.1

742 aa

371

742

HUN

PF08729 HUN 132-177 aa

XP_057795686.1

737 aa

368

737

HUN

PF08729 HUN 132-177 aa

XP_057795687.1

734 aa

367

734

HUN

PF08729 HUN 132-177 aa

XP_057795688.1

734 aa

367

734

HUN

PF08729 HUN 132-177 aa

XP_057795689.1

729 aa

364

729

HUN

PF08729 HUN 132-177 aa

XP_057795690.1

718 aa

359

718

HUN

PF08729 HUN 132-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795680.1`	Pfam	`PF08729`	HUN	Domain	132	177	1.9e-13	50.9	HPC2 and ubinuclein domain
`XP_057795681.1`	Pfam	`PF08729`	HUN	Domain	132	177	1.9e-13	50.9	HPC2 and ubinuclein domain
`XP_057795682.1`	Pfam	`PF08729`	HUN	Domain	132	177	1.9e-13	50.9	HPC2 and ubinuclein domain
`XP_057795683.1`	Pfam	`PF08729`	HUN	Domain	132	177	1.9e-13	51.0	HPC2 and ubinuclein domain
`XP_057795684.1`	Pfam	`PF08729`	HUN	Domain	132	177	1.8e-13	51.0	HPC2 and ubinuclein domain
`XP_057795685.1`	Pfam	`PF08729`	HUN	Domain	132	177	1.9e-13	51.0	HPC2 and ubinuclein domain
`XP_057795686.1`	Pfam	`PF08729`	HUN	Domain	132	177	1.8e-13	51.0	HPC2 and ubinuclein domain
`XP_057795687.1`	Pfam	`PF08729`	HUN	Domain	132	177	1.8e-13	51.0	HPC2 and ubinuclein domain
`XP_057795688.1`	Pfam	`PF08729`	HUN	Domain	132	177	1.8e-13	51.0	HPC2 and ubinuclein domain
`XP_057795689.1`	Pfam	`PF08729`	HUN	Domain	132	177	1.8e-13	51.0	HPC2 and ubinuclein domain
`XP_057795690.1`	Pfam	`PF08729`	HUN	Domain	132	177	1.8e-13	51.0	HPC2 and ubinuclein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

11 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939697.1
AGCAAAAGATGTGTGCCTTTTACAGTTCTTAGTTAATTGCTTCAACTACAGCAGTCCGCAACCGTTAAATAGGAACCAAAGAAAAGGGGAAAAATTAGACAACGCAAAATCTCCCTCTCTCTGATCAACTCCACTCCTAGGGTTTTTCCCCTAAATTTCAATTCTCCGGAAACCTAGCTCCCGCAAATTGTTGGTGGAACTCTGGATTAATGGTCGACGCCGGCGGTTCGGAATCGTGTTCCGGGTCAAAACCAATGTCC...

XM_057939700.1
AGCAAAAGATGTGTGCCTTTTACAGTTCTTAGTTAATTGCTTCAACTACAGCAGTCCGCAACCGTTAAATAGGAACCAAAGAAAAGGGGAAAAATTAGACAACGCAAAATCTCCCTCTCTCTGATCAACTCCACTCCTAGGGTTTTTCCCCTAAATTTCAATTCTCCGGAAACCTAGCTCCCGCAAATTGTTGGTGGAACTCTGGATTAATGGTCGACGCCGGCGGTTCGGAATCGTGTTCCGGGTCAAAACCAATGTCC...

CDS

11 records

下载 CDS FASTA

LOC131011830
ATGGTCGACGCCGGCGGTTCGGAATCGTGTTCCGGGTCAAAACCAATGTCCACGTGCGAATCACACGGCGACCGTCTCCGGTTCACGGTGGAGCTGCGGCCAGGAGAAACAACAATCGTTTCGTGGAAGAAGCTTCTTAAGGAGACAACTTCCAGTAAGCCCAATAAGCATGGTCCTAGAGCTGCTGGCCCGTCCTCAGCGGCCAATCAGCAGCCAGCTCCGCAGCCCCATCCCCCTCCTACGCCACCTGCATTGGCCTC...

Protein

11 records

下载 Protein FASTA

XP_057795680.1
MVDAGGSESCSGSKPMSTCESHGDRLRFTVELRPGETTIVSWKKLLKETTSSKPNKHGPRAAGPSSAANQQPAPQPHPPPTPPALASSEQPAENDVKDAQGQAGTNRLSTVIEKIERMYAGEGTSEDEEVFLDDVPDDDEYDTEDSFIDDAELDDYFQVDNSSIKHDGFFVNRGKLERIEPTTSAKQQPRKRRRKDVTKTQGGNEDVQNPNKHIKLGNKGRKSSSSIERNTTSQFNLHSTNVLEASQADAAGGSMKKKTA...

XP_057795681.1
MVDAGGSESCSGSKPMSTCESHGDRLRFTVELRPGETTIVSWKKLLKETTSSKPNKHGPRAAGPSSAANQQPAPQPHPPPTPPALASSEQPAENDVKDAQGQAGTNRLSTVIEKIERMYAGEGTSEDEEVFLDDVPDDDEYDTEDSFIDDAELDDYFQVDNSSIKHDGFFVNRGKLERIEPTTSAKQQPRKRRRKDVTKTQGGNEDVQNPNKHIKLGNKGRKSSSSIERNTTSQFNLHSTNVLEASQADAAGGSMKKKTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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