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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002809`

染色体: Chr02 坐标: 48141161-48146228 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002809`
名称	SmilChr02G002809
描述	uncharacterized SmilChr02G002809
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	48141161 - 48146228 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011837`
GeneID	`131011837`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011837`
原始查询	`SmilChr02G002809`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241299]; symbol=AT1G21651; hit=AT1G21651; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241299]; symbol=AT1G21651; hit=AT1G21651; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G21651` (AT1G21651) zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241299] identity=41.3; qcov=1; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os05g0422300` - identity=29.5; qcov=0.841; evalue=1.1e-71; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40); PF13445 (zf-RING_UBOX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011837

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057795696.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057795696.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057795696.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795696.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795696.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:48141668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C86
`Chr2:48141688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C8
`Chr2:48141701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr2:48141717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr2:48141899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B95,C14
`Chr2:48141954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C62
`Chr2:48142313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B76,C47,C74
`Chr2:48142718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B30,B34,B70,C26,C37
`Chr2:48142736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C8
`Chr2:48142753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B15,B4,C78
`Chr2:48144593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr2:48144752`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B15,B4,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795696.1

843 aa

422

843

zf-RING_UBOX

WD40

PF13445 zf-RING_UBOX 20-61 aa PF00400 WD40 552-583 aa PF00400 WD40 589-626 aa PF00400 WD40 682-714 aa PF00400 WD40 763-794 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795696.1`	Pfam	`PF13445`	zf-RING_UBOX	Domain	20	61	1.4e-07	32.1	RING-type zinc-finger
`XP_057795696.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	552	583	6.5e-21	74.6	WD domain, G-beta repeat
`XP_057795696.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	589	626	6.5e-21	74.6	WD domain, G-beta repeat
`XP_057795696.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	682	714	6.5e-21	74.6	WD domain, G-beta repeat
`XP_057795696.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	763	794	6.5e-21	74.6	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939713.1
GAGGATTTTGATTTGATTTTACAAGTATCTTTATAGTAGGAGTAGTATTTTTTCCTTTCCCCGACTCCGCGGGAAAAAAAACAACCGAGATGCAGCAAGTCAATGATCCGCCGCCGTCCGCCGTGGAAGAGGCAGAGCCGCCGGAGTGCCCGGTATGTCTGCAGCCTTACGACGCCGTGACGGCCATCCCGCGCGTCCTGAGCTGCGGCCACACCACCTGCGAAGCGTGCCTGAAGTTGCTCCCCCGCCCATTCCCCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011837
ATGCAGCAAGTCAATGATCCGCCGCCGTCCGCCGTGGAAGAGGCAGAGCCGCCGGAGTGCCCGGTATGTCTGCAGCCTTACGACGCCGTGACGGCCATCCCGCGCGTCCTGAGCTGCGGCCACACCACCTGCGAAGCGTGCCTGAAGTTGCTCCCCCGCCCATTCCCCAACACTATCCGCTGCACCGTCTGCACCCTCCTCCTCAAATTACCCAACTCGCTCTCTTCGCTCCCCAAGAACCTCGACCTCCTCTATTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795696.1
MQQVNDPPPSAVEEAEPPECPVCLQPYDAVTAIPRVLSCGHTTCEACLKLLPRPFPNTIRCTVCTLLLKLPNSLSSLPKNLDLLYFSSLLQRTRPLEEKTVIPPGTKSASPPSVLKRWPHEFYCRWRRWILPEDCISIGGARLDSDGGVFDGIVLRVFGSDRVLGCVLREKEYVGLVKVGILVEGSKLIKPSYESGILTVLWGMGEEERDKLGVILNAGFRVSNVGKAYGFWCDEADKSVYIVFQKFASSNFITDCVFKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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