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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002822`

染色体: Chr02 坐标: 48336525-48342033 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002822`
名称	SmilChr02G002822
描述	metal transporter Nramp7.2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	48336525 - 48342033 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011851`
GeneID	`131011851`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011851`
原始查询	`SmilChr02G002822`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	metal transporter Nramp7.2-like
产物	metal transporter Nramp7.2-like
Arabidopsis	`AT1G15960` (NRAMP6) NRAMP metal ion transporter 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838166] identity=63.1; qcov=0.887; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0257200` (OsNramp5) - identity=75.6; qcov=0.908; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005384 (manganese ion transmembrane transporter activity); GO:0015086 (cadmium ion transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0030001 (metal ion transport)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01566 (Nramp)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011851

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057795708.1`
2	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.20000	`XP_057795708.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057795709.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057795709.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795709.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:48336637`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	B111,B133,B26,B47,B72,C31,C5,C56,C82,C86,D8
`Chr2:48336738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B51
`Chr2:48336749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C23,C57
`Chr2:48336754`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B44
`Chr2:48336754`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B44
`Chr2:48337967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:48338006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B36,B69,B71,B9,C62
`Chr2:48339817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr2:48339880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr2:48339923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:48339937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:48341197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795708.1

568 aa

284

568

Nramp

PF01566 Nramp 82-479 aa

XP_057795709.1

565 aa

282

565

Nramp

PF01566 Nramp 79-476 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795708.1`	Pfam	`PF01566`	Nramp	Domain	82	479	4e-127	425.1	Natural resistance-associated macrophage protein-like
`XP_057795709.1`	Pfam	`PF01566`	Nramp	Domain	79	476	3.9e-127	425.1	Natural resistance-associated macrophage protein-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939726.1
GAGTGGAATTAAATGTGAGGTTGGTCTTGGGATAGGCAATATGCAAGATTCGTTTCCATATAAATAAAGGGATGCCAAAATATTAATGCACACAACAGAAACCTTCTTCAGCTGCACAAAAACACAGTCACACACACTAGCTAGTTGTAAAAATATGGCAAGCTTGCAGCAGGGGAGTGGCAGTGGGAACAACAGCAACCGTATTGTCGCCGTGGTGCAGACACCGCCCGCCGCCGGTGATTGGGCTGCCGGAGACAAAG...

XM_057939725.1
GGCAATATGCAAGATTCGTTTCCATATAAATAAAGGGATGCCAAAATATTAATGCACACAACAGAAACCTTCTTCAGCTGCACAAAAACACAGTCACACACACTAGCTAGTTGTAAAAATATGGCAAGCTTGCAGCAGGGGAGTGGCAGTGGGAACAACAGCAACCGTATTGTCGCCGTGGTGCAGACACCGCCCGCCGCCGGTGATTGGGCTGCCGGAGACAAAGAATTCGATCAGGAAGACCAGGTGCAAGAGAAACC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011851
ATGCACACAACAGAAACCTTCTTCAGCTGCACAAAAACACAGTCACACACACTAGCTAGTTGTAAAAATATGGCAAGCTTGCAGCAGGGGAGTGGCAGTGGGAACAACAGCAACCGTATTGTCGCCGTGGTGCAGACACCGCCCGCCGCCGGTGATTGGGCTGCCGGAGACAAAGAATTCGATCAGGAAGACCAGGTGCAAGAGAAACCAGGGTGGAAAAATTTCTTGAAGCATGTTGGCCCTGGTTTCTTGGTCTCATT...

LOC131011851
ATGCACACAACAGAAACCTTCTTCAGCTGCACAAAAACACAGTCACACACACTAGCTAGTTGTAAAAATATGGCAAGCTTGCAGCAGGGGAGTGGCAGTGGGAACAACAGCAACCGTATTGTCGCCGTGGTGCAGACACCGCCCGCCGCCGGTGATTGGGCTGCCGGAGACAAAGAATTCGATCAGGAAGACCAGAAACCAGGGTGGAAAAATTTCTTGAAGCATGTTGGCCCTGGTTTCTTGGTCTCATTGGCTTACCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057795708.1
MHTTETFFSCTKTQSHTLASCKNMASLQQGSGSGNNSNRIVAVVQTPPAAGDWAAGDKEFDQEDQVQEKPGWKNFLKHVGPGFLVSLAYLDPGNLETDLQAGANHGYELLWVILIGLVFALIIQSLAANLGVSTGKHLAELCKAEYPIFVKYSLWILAELAVIAADIPEVIGTAFALNILFNIPVWVGVLCTGCSTLLLLGLQRYGVRKLELLIAILVFIMAACFFGELSYVKPPAKEVMKGMFVPKLSGQGATGDAIAL...

XP_057795709.1
MHTTETFFSCTKTQSHTLASCKNMASLQQGSGSGNNSNRIVAVVQTPPAAGDWAAGDKEFDQEDQKPGWKNFLKHVGPGFLVSLAYLDPGNLETDLQAGANHGYELLWVILIGLVFALIIQSLAANLGVSTGKHLAELCKAEYPIFVKYSLWILAELAVIAADIPEVIGTAFALNILFNIPVWVGVLCTGCSTLLLLGLQRYGVRKLELLIAILVFIMAACFFGELSYVKPPAKEVMKGMFVPKLSGQGATGDAIALLGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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