当前解析结果
SmilChr02G002831| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002831 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002831 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002831 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 48438113 - 48440131 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131011858 |
|---|---|
| GeneID | 131011858 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011858 |
| 原始查询 | SmilChr02G002831 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011858 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.80000 | XP_057795719.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057795719.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057795719.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057795719.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795719.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:48438642 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 35 | A6,B100,B103,B109,B123,B128,B136,B139,B33,B38,B5,B55,B70,B83,B84,B85,B89,C11,C16,C20,C22,C23,C27,C29,C35,C49,C53,C73,C74,C75,C81,C87,C9,D7,D8 |
Chr2:48439187 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B62,B77,B90,B92,C37,C63 |
Chr2:48439206 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | A25,B134,B39,C13,C59,C84,D10 |
Chr2:48439243 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B13,B65,B73,C25 |
Chr2:48439297 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B118,B34 |
Chr2:48439316 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B23,B35,C3 |
Chr2:48439316 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B23,B35,C3 |
Chr2:48439338 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 168 | A1,A10,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A22,A23,A25,A4,A7,A8,A9,B10,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B11,B110,B111,B112,B114,B115,B117,B118,B12,B124,B125,B126,B13,B132,B133,B135,B137,B140,B15,B16,B19,B2,B20,B21,B22,B24,B25,B27,B28,B29,B31,B32,B33,B35,B36,B37,B4,B40,B41,B42,B44,B45,B46,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B57,B6,B60,B61,B64,B65,B67,B68,B69,B71,B72,B73,B74,B76,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B9,B90,B92,B93,B94,B96,B97,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C2,C22,C23,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C35,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C44,C47,C49,C52,C53,C54,C55,C58,C59,C6,C62,C65,C67,C68,C69,C7,C71,C73,C74,C77,C8,C80,C81,C82,C84,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9 |
Chr2:48439392 |
CTG |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B6 |
Chr2:48439392 |
CTG |
C |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B6 |
Chr2:48439831 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B32 |
Chr2:48439884 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B104,B129,C11,C69 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。