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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002832`

染色体: Chr02 坐标: 48466384-48467903 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002832`
名称	SmilChr02G002832
描述	NAC domain-containing protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	48466384 - 48467903 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011859`
GeneID	`131011859`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011859`
原始查询	`SmilChr02G002832`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAC domain-containing protein 2-like
产物	NAC domain-containing protein 2-like
Arabidopsis	`AT1G01720` (ATAF1) NAC (No Apical Meristem) domain transcriptional regulator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839265] identity=65.5; qcov=1.04; evalue=1.15e-130; confidence=high
Rice	`Os01g0884300` (OsNAC6) - identity=68.7; qcov=0.899; evalue=3.81e-122; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02365 (NAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011859

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795722.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795722.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795722.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795722.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795722.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:48466530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:48466560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr2:48466587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:48466638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:48466818`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B140,B23,C7,C73,C81,D3,D7
`Chr2:48466830`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B140,B23,C7,C73,C81,D3,D7
`Chr2:48466873`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B6
`Chr2:48466873`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B6
`Chr2:48466881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B5,C29,C80
`Chr2:48466923`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A22,B107,B43,B5
`Chr2:48466923`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A22,B107,B43,B5
`Chr2:48466925`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A22,B107,B5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795722.1

288 aa

144

288

NAM

PF02365 NAM 9-132 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795722.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	9	132	1.2e-49	168.6	No apical meristem (NAM) protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939739.1
AGTTTCACAAAACCCCTCCTCTCTCACTTTCCCTTTGCTCTCACCCAAATTTCACACACATATTTGTAATATATTTTTATATACAGAGAGAGAGAGAAGGAGATTTTTTATATATTAAATCTTTCAAATTTCTCCGAGGAAATGGCCGCCGTCAATTTGCAACTGCCGCCGGGATTCCGGTTCCACCCGACCGACGAAGAGCTCGTCATGCACTACTTGATCCGGAAATGTGCATCTCAATCCATCGCCGTTCCGATCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011859
ATGGCCGCCGTCAATTTGCAACTGCCGCCGGGATTCCGGTTCCACCCGACCGACGAAGAGCTCGTCATGCACTACTTGATCCGGAAATGTGCATCTCAATCCATCGCCGTTCCGATCATCGCCGAAATCGACCTCTACAAGTACGATCCCTGGGAATTACCAGGTTTATCTTTGTACGGTGAGAAGGAGTGGTACTTCTTCTCGCCCCGGGACCGGAAGTATCCGAACGGTTCGAGGCCGAACCGCGCTGCCGGCAGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795722.1
MAAVNLQLPPGFRFHPTDEELVMHYLIRKCASQSIAVPIIAEIDLYKYDPWELPGLSLYGEKEWYFFSPRDRKYPNGSRPNRAAGSGYWKATGADKPIGQPKSVGIKKALVFYSGKAPRGEKTNWIMHEYRLADVDRSARKKNNSLRLDDWVLCRIYNKKGTIERRQQQQQQASVSSRNMTSAVTTEEDTKPVILTSVPESSAMVYDDFMYLDASDSMPRLHTDSSCSEHVLSPEVESAPKLAEWERSALDFPFGYMDGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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