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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002859`

染色体: Chr02 坐标: 48772585-48777190 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002859`
名称	SmilChr02G002859
描述	F-box protein 7
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	48772585 - 48777190 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011882`
GeneID	`131011882`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011882`
原始查询	`SmilChr02G002859`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein 7
产物	F-box protein 7
Arabidopsis	`AT1G21760` (FBP7) F-box protein 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838780] identity=73.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0431200` (OsDRF1) - identity=59.9; qcov=1; evalue=4.52e-151; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0019005 (SCF ubiquitin ligase complex); GO:0031146 (SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like); PF19270 (FBO_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011882

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795756.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057795756.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057795756.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057795756.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795756.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:48773011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,D11
`Chr2:48773049`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B110
`Chr2:48773049`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B110
`Chr2:48773110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,A23,C30
`Chr2:48773179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795756.1

328 aa

164

328

F-box-like

F-box

FBO_C

PF12937 F-box-like 61-105 aa PF00646 F-box 62-100 aa PF19270 FBO_C 116-328 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795756.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	61	105	1.4e-13	51.1	F-box-like
`XP_057795756.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	62	100	3.5e-12	46.4	F-box domain
`XP_057795756.1`	Pfam	`PF19270`	FBO_C	Family	116	328	2.4e-101	338.4	F-box only protein C-terminal region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939773.1
GCTACTAAATACATTTATAACCAAGTCTTGTTTCTCTCTCTTCTTTCTCTCTCACTCCTCATTTCAGAAACAGAGGACCACGAAATTCCCGGTTCTCTCATACAAGCGCATGGGAGAAAAAAATAAAAACAAAAAAGAAAAACATAAATCACGAGCTTGCTTCAATGACTTCTGATTATGCGGTCAAACTTGCAGCGGAGCTTGAATCAGCTTCGCGTTTGAGAGCTGCTCAATTCTTGGTGACGCAGAGGCCGTGGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011882
ATGACTTCTGATTATGCGGTCAAACTTGCAGCGGAGCTTGAATCAGCTTCGCGTTTGAGAGCTGCTCAATTCTTGGTGACGCAGAGGCCGTGGCTTGATCTTTATGGGGTTAATGTCAGACCTGTTACTCCTTTCCGTAGCTTGAGCAAACCGTTTGTTGAAACATCACTTTTACACCGCACCTTGCCTGATGAGTTGCTTTTTGAGATATTTTCAAAGATGAGTCCTTATACCCTTGGGAGAGCAACTTGTGTCTGTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795756.1
MTSDYAVKLAAELESASRLRAAQFLVTQRPWLDLYGVNVRPVTPFRSLSKPFVETSLLHRTLPDELLFEIFSKMSPYTLGRATCVCRKWRYTIRNPVFWRNACLRAWQLNGIVENYKILQSMYHGLWRKMWLLRPRLRTDGLYVSRNTYIRAGVAEWRTTNPVHIVCYFRYMRFYPSGRFLYKNSSQKVKDVAKYMNVRSSRSDTDSVFSGQYTLAEDKVEAAILYPGLRPTVLRIRLRLRGTIEGANNRMDLISLVTSG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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