当前解析结果
SmilChr02G002861| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002861 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002861 |
| 描述 | uncharacterized protein At4g08330, chloroplastic |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 48786703 - 48790314 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131011886 |
|---|---|
| GeneID | 131011886 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011886 |
| 原始查询 | SmilChr02G002861 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826387]; symbol=AT4G08330; hit=AT4G08330; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826387]; symbol=AT4G08330; hit=AT4G08330; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT4G08330 (AT4G08330)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826387] identity=67.7; qcov=0.818; evalue=1.61e-54; confidence=high |
| Rice | Os01g0833400- identity=55.9; qcov=0.855; evalue=1.39e-48; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF24046 (At4g08330) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011886 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057795759.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057795759.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057795759.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795759.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057795759.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:48789784 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B95,C53,D10 |
Chr2:48789964 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057795759.1PF24046
At4g08330 20-149 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057795759.1 |
Pfam | PF24046 |
At4g08330 | Domain | 20 | 149 | 3.6e-56 | 189.4 | At4g08330 beta-tent |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。