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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002867`

染色体: Chr02 坐标: 48826093-48844116 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002867`
名称	SmilChr02G002867
描述	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	48826093 - 48844116 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011893`
GeneID	`131011893`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011893`
原始查询	`SmilChr02G002867`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B
产物	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B
Arabidopsis	`AT1G77600` (AT1G77600) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844095] identity=42; qcov=0.786; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os06g0286351` - identity=29.9; qcov=0.796; evalue=7.35e-142; confidence=low
GO	GO:0000785 (chromatin); GO:0005634 (nucleus); GO:0006281 (DNA repair); GO:0007064 (mitotic sister chromatid cohesion)
KEGG	-
Pfam	PF20168 (PDS5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011893

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795772.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057795772.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057795772.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057795772.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795772.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:48826823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr2:48829226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B74
`Chr2:48829321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr2:48829427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr2:48829456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:48829472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr2:48829500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B74
`Chr2:48829541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B42,C43,C72,D9
`Chr2:48829770`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B98
`Chr2:48829770`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B98
`Chr2:48830436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B104,B78,C34
`Chr2:48830702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795772.1

1394 aa

697

1394

PDS5

PF20168 PDS5 35-1070 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795772.1`	Pfam	`PF20168`	PDS5	Repeat	35	1070	3e-219	731.3	Sister chromatid cohesion protein PDS5 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939789.1
ACCCAAATCATAGAAAAAAAATCGGCACTCTTTGATGCTTGCCCTCCAGTAGAAAGAACAAATTGAAGAAGTTAGTGGAAATTCAAACAAAAATCCCAAATCATTTCAGTCAATCACCAGATCCCTCAAATCCCCCAACCCTTCCCCCTTCCCCGCCAACGAAGATAAGAAGAAGCAATGCAGCCACAACTCGCTGACGCTTTTCGATTATGACTGCTTCCACTGCAACACCAGCTTTTGGTTTCGCAGGGATTCCTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011893
ATGGCGGAGGCGCGTAAGAAGCAGCAGGCGGCCAAGCAACTACTAAAGCAAATCGGCGAGCAACTCGTCGCCTGCGAAACTTGCCCAGATGAGAGCATTATCGTCAAACTACTCAAGAAAGCTACAAGTGCATTCATGGAGTTAAAGCAGTCAGACTCAGAAAATCATTCATCCAAACCACCTGGTAATTCTCGAACGAGGCAAGGCATACTTGACCAAAGAGACAGAGATGCTTGTGTTCTCGCACCAGATCCTGCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795772.1
MAEARKKQQAAKQLLKQIGEQLVACETCPDESIIVKLLKKATSAFMELKQSDSENHSSKPPGNSRTRQGILDQRDRDACVLAPDPAFSHAVSSKIFRFLLRMFEELHDTSSKYFRTRAKILETVDKLQFCLVMLDTGCEDLVLKMFKSFFSVVREDHPQSLIDSISSIITSILAENVEADPDPLERNTFQPLLDVILRNIIREKKAAASASYRLAASVVQNCSEKLKCYICRFLTSCILNRDAVGSPFKESYHEIILEIY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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