当前解析结果
SmilChr02G002888| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002888 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002888 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002888 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 49173724 - 49176010 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131011914 |
|---|---|
| GeneID | 131011914 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011914 |
| 原始查询 | SmilChr02G002888 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os04g0450500; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os04g0450500; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os04g0450500- identity=37.8; qcov=0.38; evalue=1.78e-29; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011914 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057795797.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057795797.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057795797.1 |
| 4 | Telomere | 端粒 | 0.80000 | XP_057795798.1 |
| 5 | Nuclear body | 核内小体 | 0.80000 | XP_057795798.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:49173906 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B98 |
Chr2:49173906 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B98 |
Chr2:49174002 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C32 |
Chr2:49174046 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B71,C22,C53 |
Chr2:49174125 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B124,C48,C87 |
Chr2:49174163 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C10,C18 |
Chr2:49174331 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B139,B83 |
Chr2:49174341 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
Chr2:49174525 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B101 |
Chr2:49174575 |
A |
AC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 10 | B109,B115,B130,B136,B139,C45,C48,C83,C87,D3 |
Chr2:49174592 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A21,B50,C18 |
Chr2:49175626 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B100,B35 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。