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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002896`

染色体: Chr02 坐标: 49240006-49243113 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002896`
名称	SmilChr02G002896
描述	flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	49240006 - 49243113 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011924`
GeneID	`131011924`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011924`
原始查询	`SmilChr02G002896`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase-like
产物	flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase-like
Arabidopsis	`AT5G08640` (FLS1) flavonol synthase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830765] identity=62.7; qcov=1; evalue=1.62e-156; confidence=high
Rice	`Os02g0767300` (FLS) - identity=56.1; qcov=1; evalue=2.34e-136; confidence=high
GO	GO:0009416 (response to light stimulus); GO:0045431 (flavonol synthase activity)
KEGG	smil00941 (Flavonoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011924

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057795810.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057795810.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795810.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795810.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795810.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:49240296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr2:49240344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr2:49240457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C45,C48,D3,D4
`Chr2:49240854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:49240890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr2:49240896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795810.1

335 aa

168

335

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 43-151 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 200-296 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795810.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	43	151	5.5e-26	92.2	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057795810.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	200	296	2.3e-32	112.0	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009097138.1
AACTCGTCGTATATAAAGAAAGGCAGTTGGGAGAAGAAGAAAAGTTGAAAAGAAAGAGAAAAATGGAGGTTGAGAGAGTGCAGTCTATCGCTTCACAATCGAAGCTAGCAAACATCATCCCTTCCCAATTCATCCGGTCGGAAGACGAGCAGCCGGCGGCGACCACCCTGCAGGGGGTGGTGCTGGAGGTTCCGGTGATCGACCTCGGCGGCGGCGACATTGATGATAAGACTAGGAGATTGATAAGCGAAGCAAGCAGC...

XM_057939827.1
TTGGAGTGGTCCAACTCGTCGTATATAAAGAAAGGCAGTTGGGAGAAGAAGAAAAGTTGAAAAGAAAGAGAAAAATGGAGGTTGAGAGAGTGCAGTCTATCGCTTCACAATCGAAGCTAGCAAACATCATCCCTTCCCAATTCATCCGGTCGGAAGACGAGCAGCCGGCGGCGACCACCCTGCAGGGGGTGGTGCTGGAGGTTCCGGTGATCGACCTCGGCGGCGGCGACATTGATGATAAGACTAGGAGATTGATAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011924
ATGGAGGTTGAGAGAGTGCAGTCTATCGCTTCACAATCGAAGCTAGCAAACATCATCCCTTCCCAATTCATCCGGTCGGAAGACGAGCAGCCGGCGGCGACCACCCTGCAGGGGGTGGTGCTGGAGGTTCCGGTGATCGACCTCGGCGGCGGCGACATTGATGATAAGACTAGGAGATTGATAAGCGAAGCAAGCAGCGATTGGGGGATCTTCCAAGTGGTGAACCATGGAATCCCCGATGAAGTCATAGCCAAATTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795810.1
MEVERVQSIASQSKLANIIPSQFIRSEDEQPAATTLQGVVLEVPVIDLGGGDIDDKTRRLISEASSDWGIFQVVNHGIPDEVIAKLQRVGREFFELPEEEKELIAKTPDSGIQGYGTSLQKEVQAKKAWVDHLFHIIWPPAAINYNFWPQNPPSYREANEEYAEKLLEVSEKLMKWLSLGLGLEEGELKAAMGGEDVAYLMKINYYPPCPRPDLALGVVAHTDMSAITILVPNQVQGLQVFRDEHWYDVKYIPNALIVHI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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