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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002901`

染色体: Chr02 坐标: 49292824-49299704 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002901`
名称	SmilChr02G002901
描述	uncharacterized SmilChr02G002901
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	49292824 - 49299704 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009653`
GeneID	`131009653`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009653`
原始查询	`SmilChr02G002901`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831737]; symbol=AT5G02930; hit=AT5G02930; species=arabidopsis; confidence=low
产物	F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831737]; symbol=AT5G02930; hit=AT5G02930; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G02930` (AT5G02930) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831737] identity=28.1; qcov=0.484; evalue=1.01e-19; confidence=low
Rice	`Os04g0208600` (OsFbox191) - identity=30.3; qcov=0.242; evalue=2.16e-11; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07723 (LRR_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009653

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793048.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793048.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793048.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793048.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793048.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:49292973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B69,B72,C23,C57
`Chr2:49293064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:49293140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B12,B140,C17,C26
`Chr2:49293151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B4,B91,C33
`Chr2:49293156`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr2:49293156`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B13
`Chr2:49293203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B104,B19,C58,C82
`Chr2:49293209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B104,B19,C58,C82
`Chr2:49293684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,D8,D9
`Chr2:49293940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B59,B9,C81,D6
`Chr2:49294279`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B68
`Chr2:49294279`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793048.1

735 aa

368

735

F-box

LRR_2

PF00646 F-box 6-43 aa PF00646 F-box 328-366 aa PF07723 LRR_2 492-505 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793048.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	6	43	5.1e-12	45.9	F-box domain
`XP_057793048.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	328	366	5.1e-12	45.9	F-box domain
`XP_057793048.1`	Pfam	`PF07723`	LRR_2	Repeat	492	505	0.00034	21.8	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937065.1
TCAAATTTGGGCACCAAGAAAAGTTTTGAACATATATATGAGCAATGCATCAAAAATAATCTCAAGAAATGGAGGAGGACAGAATCAGCCAACTCCCAGATGCAATTCTTCAACAAATCTTGTCCTTGATCGACATCAATCAAGCCGTTGAGACAGCCGTTCTCTCCTCAAGATGGAAAAACCTCTGGTTTTCCCTCTCCGATCTCAACTTCCACCTCAGCCGCTTCCCTCACTTCATCTCCAACTTCCTCTCTAATCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009653
ATGGAGGAGGACAGAATCAGCCAACTCCCAGATGCAATTCTTCAACAAATCTTGTCCTTGATCGACATCAATCAAGCCGTTGAGACAGCCGTTCTCTCCTCAAGATGGAAAAACCTCTGGTTTTCCCTCTCCGATCTCAACTTCCACCTCAGCCGCTTCCCTCACTTCATCTCCAACTTCCTCTCTAATCGCGACGACGCCGCCCCCATCCGCAACTTCCACCTCTCATTGGACACCGGTGGGCCGGTCCACGAATTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793048.1
MEEDRISQLPDAILQQILSLIDINQAVETAVLSSRWKNLWFSLSDLNFHLSRFPHFISNFLSNRDDAAPIRNFHLSLDTGGPVHEFVEECAYYAVSHGVQSLRLHAPGGPLLNLPAAFFASTTLRELHLRQFSGGISLPGNFCLPHLKTLYLESTRFFKHERLEMEEISAPLLTWFRYEGHYPFECPNVNLPVLEEVNLDIYKRFYEEGMRVKCVRMLQQLGNATTVALTLDILKVLGKDRSLIEQKPCPFPYLKCLKLM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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