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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002902`

染色体: Chr02 坐标: 49331026-49334757 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002902`
名称	SmilChr02G002902
描述	auxin transporter-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	49331026 - 49334757 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011929`
GeneID	`131011929`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011929`
原始查询	`SmilChr02G002902`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin transporter-like protein 3
产物	auxin transporter-like protein 3
Arabidopsis	`AT2G21050` (LAX2) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816640] identity=83.9; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0244600` (OsLAX2) - identity=83.6; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01490 (Aa_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011929

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057795812.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795812.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795812.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795812.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795812.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:49332008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B39,C25
`Chr2:49332168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr2:49332417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr2:49333563`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C33
`Chr2:49333563`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C33
`Chr2:49334146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:49334182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B45
`Chr2:49334501`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A5,B10,B129,B20,B28,B7,C15,C24,C44,C53,C6,C73,C78,C83,D11,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795812.1

464 aa

232

464

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 38-431 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795812.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	38	431	3.1e-77	260.7	Transmembrane amino acid transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939829.1
AAAATAACATGCTGCAAGCTGAGCGAACCAGGTCCCTTCATGGGTGACCCAATCATTGCTCAAGAAACGCTACACATTTTTTTGTACAAGCACGCATATACTATATGACCAATCTATAATAACGTTTTCCGTTTCAGAATATTTTTTTTCCTTAAAAAATTAAAAAGGAAAAAATGAAATAATTCCACTATTATATATGCAAACTCCCTCAAAGTCTCCACTGCTTTTCTTGTAACTCTCTCTGAACAGAAAAAAATGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011929
ATGGCTTCAGAGAAAGTGGAAACTGTGGTTGCTGGAAACTATGTGGAGATGGAGAGAGAAGAAGATGCGAAATCCACCTCCACCAAGAGCAAATTATCAAGCATATTTTGGCATGGTGGCTCAGTTTATGATGCATGGTTCAGCTGTGCTTCTAATCAGGTTGCTCAAGTGCTGCTTACACTGCCTTATTCATTTTCACAACTTGGAATGGCATCTGGGATTGTATTTCAGCTGTTGTATGGATTGATGGGGAGCTGGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795812.1
MASEKVETVVAGNYVEMEREEDAKSTSTKSKLSSIFWHGGSVYDAWFSCASNQVAQVLLTLPYSFSQLGMASGIVFQLLYGLMGSWTAYLISVLYVEYRTRKEREKVDFRNHVIQWFEVLDGLLGKHWRNIGLFFNCTFLLFGSVIQLIACASNIYYINDNLDKRTWTYIFGACCATTVFIPSFHNYRIWSFLGLIMTTYTAWYLTIASLLHGQVEGVQHSGPAKMVLYFTGATNILYTFGGHAVTVEIMHAMWKPQKFK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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