当前解析结果
SmilChr02G002903| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002903 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002903 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002903 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 49347006 - 49348582 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009654 |
|---|---|
| GeneID | 131009654 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009654 |
| 原始查询 | SmilChr02G002903 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=38; qcov=0.377; evalue=1.34e-26; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009654 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057793049.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057793049.1 |
| 3 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057793049.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793049.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057793049.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:49347016 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B33,B80,C60 |
Chr2:49347059 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B33,B80,B96,C60 |
Chr2:49347313 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B33,B78,B80,B96,C60 |
Chr2:49347314 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B21,B86,C17,C67,C87 |
Chr2:49347322 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A2,B124,C63,C7 |
Chr2:49347331 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B109,B123,B136 |
Chr2:49347332 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B21,B86,C67,C87 |
Chr2:49347336 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B46,B6,C71 |
Chr2:49347340 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B56,B96 |
Chr2:49347360 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B46,B6,C71 |
Chr2:49347362 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B78 |
Chr2:49347365 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A22,B42,B43,B86,C67 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。