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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002909`

染色体: Chr02 坐标: 49394295-49396602 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002909`
名称	SmilChr02G002909
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	49394295 - 49396602 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009655`
GeneID	`131009655`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009655`
原始查询	`SmilChr02G002909`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=26; qcov=0.93; evalue=2.14e-42; confidence=low
Rice	`Os11g0681300` - identity=25.6; qcov=0.887; evalue=2.43e-40; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009655

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793050.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793050.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793050.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793050.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793050.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:49394325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B111,B140,C18,C9
`Chr2:49394339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:49394504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A4,B63,B81,B83,C76
`Chr2:49394504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B63,B81,B83,C76
`Chr2:49394623`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A2,A7,B10,B80,B93,C1,C62,C72
`Chr2:49394653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B32,B60
`Chr2:49394655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D11
`Chr2:49394658`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B78
`Chr2:49394658`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B78
`Chr2:49394677`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B67
`Chr2:49394677`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B67
`Chr2:49394687`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793050.1

529 aa

264

529

MULE

PF10551 MULE 150-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793050.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	150	200	3e-09	37.9	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937067.1
ATGGCCAAAGTGAAGCTCCAAATTACAACCGGTGGACGTTACTATATACGGTTCTTTATGGAAGGTCACACCCATTTGATGGTTCCTGGTCCCACTCGTCATTTGATGCCTAGCAATAGGGAAGTTGGGAAAATTCCTCAGATGCTCATTGTGTCTGGTATAAAGGCGAATATTGGTCTGATGCGTACTTTTCGAATGTACAGAGAAATAGTCGGCAGTTATGAAGAGGTGGGATGTACTAGCAATGACTTCAAGAATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009655
ATGGCCAAAGTGAAGCTCCAAATTACAACCGGTGGACGTTACTATATACGGTTCTTTATGGAAGGTCACACCCATTTGATGGTTCCTGGTCCCACTCGTCATTTGATGCCTAGCAATAGGGAAGTTGGGAAAATTCCTCAGATGCTCATTGTGTCTGGTATAAAGGCGAATATTGGTCTGATGCGTACTTTTCGAATGTACAGAGAAATAGTCGGCAGTTATGAAGAGGTGGGATGTACTAGCAATGACTTCAAGAATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793050.1
MAKVKLQITTGGRYYIRFFMEGHTHLMVPGPTRHLMPSNREVGKIPQMLIVSGIKANIGLMRTFRMYREIVGSYEEVGCTSNDFKNYVRDLKVNLKDSDAHMLLEAFFNKQELGLGFRYFHDIDEQQKMRRLIWIDELAVKNYKLFGEALSFDATYCTNRYKLIFTAFTGIDNYGKCISFGAVLISREDMDSYSWFCMWHTNIKVTEKLPLRLRDDSNFRSKYDKIVWSDHDDPEVFEENWKDMIEEYDLASNRWLSDMY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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