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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002913`

染色体: Chr02 坐标: 49428195-49433627 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002913`
名称	SmilChr02G002913
描述	cytochrome c-type biogenesis CcmH-like mitochondrial protein
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	49428195 - 49433627 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011937`
GeneID	`131011937`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011937`
原始查询	`SmilChr02G002913`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome c-type biogenesis CcmH-like mitochondrial protein
产物	cytochrome c-type biogenesis CcmH-like mitochondrial protein
Arabidopsis	`AT1G15220` (CCMH) cytochrome c biosis protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838089] identity=62.3; qcov=1.05; evalue=5.92e-66; confidence=high
Rice	`Os02g0275100` (CCMH) - identity=68.2; qcov=0.974; evalue=7.36e-77; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03918 (CcmH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011937

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.80000	`XP_057795825.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057795825.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.60000	`XP_057795825.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057795825.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795825.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:49428346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B129,B21,B37,B8
`Chr2:49428347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B51,C82
`Chr2:49428347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C82
`Chr2:49428367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr2:49428367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:49428459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C53
`Chr2:49428476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104
`Chr2:49428476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:49428495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A7,B10,B126,B80,B93,C1,C62,C72
`Chr2:49428638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:49428965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795825.1

152 aa

152

CcmH

PF03918 CcmH 3-114 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795825.1`	Pfam	`PF03918`	CcmH	Family	3	114	2.4e-28	98.9	Cytochrome C biogenesis protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939842.1
TAAACCCTTTCATTGTAATCTTCAGCTCACAACTCTTTAGCCCTCTCCTTTTTCTTGTCGATTTCTGAAGAGATCAAAGAGCAGTTGTATTGGGGTGAAAGGTTCATGGAGAATGAGGATGAAGTGAGAAAGGATCGTGTGGTCGAAGCACGGGCCAGAAATATAAGCCACAATGTGCGGTGCACTGAATGTGGTAGTCAATCTATTGAAGACTCGCAAGCTGACATTGCCATTCTCCTCCGCAAGTTAATACGAGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011937
ATGGAGAATGAGGATGAAGTGAGAAAGGATCGTGTGGTCGAAGCACGGGCCAGAAATATAAGCCACAATGTGCGGTGCACTGAATGTGGTAGTCAATCTATTGAAGACTCGCAAGCTGACATTGCCATTCTCCTCCGCAAGTTAATACGAGATGAAATTCGGTCTGGTAAAAACGACAAAGAGATCTACAAGAAGCTGGAGGAAGATTTTGGTGAGACGGTGCTTTATACACCAAAATTTGATATACAAACAGCAGCTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795825.1
MENEDEVRKDRVVEARARNISHNVRCTECGSQSIEDSQADIAILLRKLIRDEIRSGKNDKEIYKKLEEDFGETVLYTPKFDIQTAAIWLALLTLTGGAVAIWAFNRYRRKNNVHIMALDLVRGVPLTLKERETMFELLTPPSTRWWGKWLPR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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