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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002924`

染色体: Chr02 坐标: 49645104-49649297 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002924`
名称	SmilChr02G002924
描述	protein WHAT'S THIS FACTOR 9, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	49645104 - 49649297 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011946`
GeneID	`131011946`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011946`
原始查询	`SmilChr02G002924`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein WHAT'S THIS FACTOR 9, mitochondrial-like
产物	protein WHAT'S THIS FACTOR 9%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT2G39120` (WTF9) Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818498] identity=57.9; qcov=0.868; evalue=1.23e-146; confidence=high
Rice	`Os03g0786600` - identity=44.1; qcov=0.968; evalue=2.38e-103; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF11955 (PORR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011946

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057795829.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057795829.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795829.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795829.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795829.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:49647898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,C81,D4
`Chr2:49647911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,C81,D4
`Chr2:49648325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C8
`Chr2:49648422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B21,C3
`Chr2:49648551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C62
`Chr2:49648582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr2:49648741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr2:49648754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr2:49648792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B32,B64,C63,C83
`Chr2:49648855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B46,C4,C70
`Chr2:49649067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B42,B43,B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795829.1

410 aa

205

410

PORR

PF11955 PORR 45-379 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795829.1`	Pfam	`PF11955`	PORR	Family	45	379	1.8e-96	323.7	Plant organelle RNA recognition domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939846.1
ATTTTCCTACTTCCTAGTTAAGTAAACAACCCTTCATTGTTTTTAATCCTCACAATTCTAAACCATTCCACAGCAGTCAGCCGAAATCAGAGCACCCACACCAAGAGCTCAGCATCAACAGTTTACTTGCTGTATTCGGTGCCGGAGTCAGAATCGGTTTCCGGTGGCGTTGGGGGCTACTGCGAGAAATATCCGCCCCCTTTTCTGAACAGAGGATATTGAGTTGCTGAGGAATCCATTGCAGCTGCCACCACATATTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011946
ATGAGGCCAGTCCTTCTCGAGAAAGTCCTCTTCACCTATAATAAGAACCGTGTCTCCTCCTTTACTTGTGCTCCTTCACCTCCCTACTCCTACATTCAAGCACAAACTTATGTGCAGGCATATATGAAATGGAAAAAGGACCCCTACTTTGACTCGATTGATTCGATTCACAAGTCCCTTGAACTGAAGCCCATAATCGCTGTGAAAAATTTCTTTATCACAACATCTTCCTCGCCACATGACAAATATTCCATTCCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795829.1
MRPVLLEKVLFTYNKNRVSSFTCAPSPPYSYIQAQTYVQAYMKWKKDPYFDSIDSIHKSLELKPIIAVKNFFITTSSSPHDKYSIPISAVSKKGSEFDISIKVIRFLRNYPSFFEEFKGPCYNLPWFRLTDTAIELDKEERLVYEEFRDDILGRLKKFIMMSGSAQMLPLKVIKGLRWYLGLPNEFFRDPTEYIGGDGHFRIVDIEDGLKGLAVIESDKILSVMQQNAMRKGIYNGGADEAIAFPLFPSKGLRLKQKIKD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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