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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002926`

染色体: Chr02 坐标: 49666210-49667026 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002926`
名称	SmilChr02G002926
描述	uncharacterized SmilChr02G002926
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	49666210 - 49667026 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011948`
GeneID	`131011948`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011948`
原始查询	`SmilChr02G002926`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833604]; symbol=AT5G36080; hit=AT5G36080; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833604]; symbol=AT5G36080; hit=AT5G36080; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G36080` (AT5G36080) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833604] identity=31.9; qcov=0.681; evalue=2.18e-07; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011948

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795830.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795830.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795830.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795830.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795830.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:49666253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C54
`Chr2:49666351`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	43	A14,A18,A20,A22,B100,B110,B117,B122,B135,B137,B139,B140,B18,B2,B41,B42,B5,B59,B61,B64,B67,B7,B79,B81,B84,B97,C14,C19,C30,C32,C33,C42,C44,C45,C5,C54,C59,C61,C66,C77,C79,C84,C87
`Chr2:49666354`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	43	A14,A18,A20,A22,B100,B110,B117,B122,B135,B137,B139,B140,B18,B2,B41,B42,B5,B59,B61,B64,B67,B7,B79,B81,B84,B97,C14,C19,C30,C32,C33,C42,C44,C45,C5,C54,C59,C61,C66,C77,C79,C84,C87
`Chr2:49666359`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	43	A14,A16,A18,A20,A22,B100,B110,B117,B122,B135,B137,B139,B140,B18,B2,B41,B42,B5,B59,B61,B64,B67,B7,B79,B81,B84,B97,C14,C19,C30,C32,C33,C42,C44,C45,C5,C59,C61,C66,C77,C79,C84,C87
`Chr2:49666384`	`C`	`CT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	2	B74,C17
`Chr2:49666384`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B74,C17
`Chr2:49666413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C22
`Chr2:49666413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:49666417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr2:49666428`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A15
`Chr2:49666428`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A15
`Chr2:49666499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A1,A14,B107,B112,B118,B122,B30,B34,B54,B7,B83,B96,C25,C5,C60,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795830.1

138 aa

138

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 2-90 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795830.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	2	90	9.9e-10	40.0	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939847.1
TGTATGGTCAGAAGCAATGGAAGCAAAGCTAATGGAATTAATCGTTTCCGAAAGCGATTCAAAGGGTAACCCAAAAGGACTTCCTAAGTCATGTGACTTCCTTGTAAAAGTGCAAGAAACGCTTAATGCACAATTCAACATGAACGAAGGTGTATATTTCTATATTTCGAAAATCGATTATCTTCAAACCAGGTATCAAGCTTGGGTGTCTCTTTTGCACGAACAGGGAGTCTTTTGGGATGACCTTAGCAACACAGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011948
ATGGAAGCAAAGCTAATGGAATTAATCGTTTCCGAAAGCGATTCAAAGGGTAACCCAAAAGGACTTCCTAAGTCATGTGACTTCCTTGTAAAAGTGCAAGAAACGCTTAATGCACAATTCAACATGAACGAAGGTGTATATTTCTATATTTCGAAAATCGATTATCTTCAAACCAGGTATCAAGCTTGGGTGTCTCTTTTGCACGAACAGGGAGTCTTTTGGGATGACCTTAGCAACACAGTGAGGGCCTCCGATGAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795830.1
MEAKLMELIVSESDSKGNPKGLPKSCDFLVKVQETLNAQFNMNEGVYFYISKIDYLQTRYQAWVSLLHEQGVFWDDLSNTVRASDETWRRIQETNSTQMLYRERGEPHYVALAKLFHEEVFKYLDYDESEPESESNSD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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