当前解析结果
SmilChr02G002928| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002928 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002928 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002928 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 49676011 - 49676834 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131011950 |
|---|---|
| GeneID | 131011950 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011950 |
| 原始查询 | SmilChr02G002928 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011950 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057795832.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057795832.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057795832.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795832.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057795832.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:49676206 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B64 |
Chr2:49676224 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C28 |
Chr2:49676250 |
AAG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B121 |
Chr2:49676250 |
AAG |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B121 |
Chr2:49676292 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B139 |
Chr2:49676293 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B45,C2,C32,C54,C60 |
Chr2:49676294 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B81 |
Chr2:49676305 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B15,B62 |
Chr2:49676388 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B18,B47,B85,C17,C2 |
Chr2:49676428 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | C48,C61,C64,C66 |
Chr2:49676429 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 45 | A13,A19,A2,A22,B102,B109,B111,B121,B127,B128,B129,B131,B137,B15,B18,B28,B31,B4,B42,B53,B6,B66,B73,B74,B86,B90,B94,B95,C11,C17,C22,C23,C33,C35,C40,C45,C49,C50,C65,C67,C69,C75,C76,C84,D8 |
Chr2:49676455 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。