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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002935`

染色体: Chr02 坐标: 49845838-49846287 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002935`
名称	SmilChr02G002935
描述	uncharacterized SmilChr02G002935
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	49845838 - 49846287 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009664`
GeneID	`131009664`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009664`
原始查询	`SmilChr02G002935`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007784]; symbol=AT1G47497; hit=AT1G47497; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007784]; symbol=AT1G47497; hit=AT1G47497; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G47497` (AT1G47497) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007784] identity=29; qcov=0.879; evalue=4.76e-08; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009664

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793057.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057793057.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793057.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793057.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793057.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:49845889`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	B106,B111,B133,B38,B47,B48,B55,B63,B67,B73,B89,B97,C13,C31,C56,C59,C84,D4
`Chr2:49845911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B137,B76,B98
`Chr2:49845911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B76,B98
`Chr2:49845931`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B100,B111,B41,B42,B43,B80,C4,C68,C70,C71
`Chr2:49845935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C62,D3
`Chr2:49845948`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	A14,A5,A8,B101,B121,B15,B22,B23,B28,B29,B40,B52,B7,B76,C16,C36,C37,C72,D8,D9
`Chr2:49845949`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	20	A14,A5,A8,B101,B121,B15,B22,B23,B28,B29,B40,B52,B7,B76,C16,C36,C37,C72,D8,D9
`Chr2:49845954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B59,B8,B93,C2
`Chr2:49845955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B30,B54,C79
`Chr2:49845966`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A25,B103,B136,B71,B91,C62,D2,D3
`Chr2:49845998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:49846004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793057.1

149 aa

149

RVT_3

PF13456 RVT_3 9-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793057.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	9	118	2.7e-14	53.9	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937074.1
ATGGATGGCTCGATTAGGGAATCTAGTATTATGCATGCAGACGTGGTTACGCGTAATGCTTTTAATGAGGTGGTGGGCTGCTATCATTTTTCTGGAGGTCATGGAGCTGCACTGGAGGCTGAGCTCTTCGCCATTATTATTGCTATGGAGACGGCGTATCAGATGGGTTGGTCTCACGTCTGGTTCGAGTCTGATTCTTCCTTTGTGGTGAGCGTGCTTCATTCTCGAGCTTCTAATGTACCGTGGCGGTTTAAGGCGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009664
ATGGATGGCTCGATTAGGGAATCTAGTATTATGCATGCAGACGTGGTTACGCGTAATGCTTTTAATGAGGTGGTGGGCTGCTATCATTTTTCTGGAGGTCATGGAGCTGCACTGGAGGCTGAGCTCTTCGCCATTATTATTGCTATGGAGACGGCGTATCAGATGGGTTGGTCTCACGTCTGGTTCGAGTCTGATTCTTCCTTTGTGGTGAGCGTGCTTCATTCTCGAGCTTCTAATGTACCGTGGCGGTTTAAGGCGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793057.1
MDGSIRESSIMHADVVTRNAFNEVVGCYHFSGGHGAALEAELFAIIIAMETAYQMGWSHVWFESDSSFVVSVLHSRASNVPWRFKARWKQALLYASSYTCKIFHIFQEGNRALDYMASTLIEEGFWSYVIHGLQPIVEDGVRKSYVRMV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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