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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002936`

染色体: Chr02 坐标: 49871369-49879247 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002936`
名称	SmilChr02G002936
描述	biotin--protein ligase 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	49871369 - 49879247 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011958`
GeneID	`131011958`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011958`
原始查询	`SmilChr02G002936`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	biotin--protein ligase 2-like
产物	biotin--protein ligase 2-like
Arabidopsis	`AT2G25710` (HCS1) holocarboxylase synthase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817112] identity=63.9; qcov=0.989; evalue=1.14e-173; confidence=high
Rice	`Os02g0167000` - identity=58.5; qcov=0.899; evalue=2.61e-136; confidence=high
GO	GO:0004077 (biotin--[biotin carboxyl-carrier protein] ligase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0036211 (protein modification process)
KEGG	smil00780 (Biotin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02237 (BPL_C); PF03099 (BPL_LplA_LipB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011958

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057795844.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057795844.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057795845.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795844.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795844.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:49871884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B60
`Chr2:49874309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B140,B35
`Chr2:49878754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr2:49878797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:49878828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:49878865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:49879155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B42,B43
`Chr2:49879163`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C43,D9
`Chr2:49879163`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C43,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795844.1

370 aa

185

370

BPL_LplA_LipB

PF03099 BPL_LplA_LipB 114-241 aa

XP_057795845.1

367 aa

184

367

BPL_LplA_LipB

BPL_C

PF03099 BPL_LplA_LipB 114-241 aa PF02237 BPL_C 303-358 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795844.1`	Pfam	`PF03099`	BPL_LplA_LipB	Domain	114	241	3e-32	112.1	Biotin/lipoate A/B protein ligase family
`XP_057795845.1`	Pfam	`PF03099`	BPL_LplA_LipB	Domain	114	241	2.9e-32	112.1	Biotin/lipoate A/B protein ligase family
`XP_057795845.1`	Pfam	`PF02237`	BPL_C	Domain	303	358	9.8e-07	29.3	Biotin protein ligase C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009097150.1
ATGACAATGAAAAATCCCTGAAAAAGCTGCGAAATTGATATCTCCGCCTCCACTGCCAGTGCCAGTCTCCCATGCTCTTTGTAACCAGCTCCCCTCGCTTTCTCTCTCTAATACGACCTCCTCCGCTTCTCTCTCTTCAAAACCTCAGCTTCTCCCCCAAGAATCTCTACTTATCATCAAAAATGGAGTCGGAATCATCTACGACGCTCGTGCTTTGCGGAAAGTCGGCTGCAGAAGACGAATTTGCGCGGCGCTTGAAG...

XR_009097151.1
CTCCACTGCCAGTGCCAGTCTCCCATGCTCTTTGTAACCAGCTCCCCTCGCTTTCTCTCTCTAATACGACCTCCTCCGCTTCTCTCTCTTCAAAACCTCAGCTTCTCCCCCAAGAATCTCTACTTATCATCAAAAATGGAGTCGGAATCATCTACGACGCTCGTGCTTTGCGGAAAGTCGGCTGCAGAAGACGAATTTGCGCGGCGCTTGAAGACGAACAACGCATTGAAACTCCCCGATGGATCGCCGGTGAGTGTGTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011958
ATGCTCTTTGTAACCAGCTCCCCTCGCTTTCTCTCTCTAATACGACCTCCTCCGCTTCTCTCTCTTCAAAACCTCAGCTTCTCCCCCAAGAATCTCTACTTATCATCAAAAATGGAGTCGGAATCATCTACGACGCTCGTGCTTTGCGGAAAGTCGGCTGCAGAAGACGAATTTGCGCGGCGCTTGAAGACGAACAACGCATTGAAACTCCCCGATGGATCGCCGGTGAGTGTGTGTTTGCATTCGGAGACTGAGAGTGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057795844.1
MLFVTSSPRFLSLIRPPPLLSLQNLSFSPKNLYLSSKMESESSTTLVLCGKSAAEDEFARRLKTNNALKLPDGSPVSVCLHSETESAGNDGVFRVNSYMNSISTSRFGRLLVYSPRLASTHDVVANNFGELPIGSVCVADVQFKGRGRSKNVWESPKGCLLFSFTIQMEDGRVVPLVQYVVCLAMTEAVNDVCRRNGMPSLDVRIKWPNDLYLDGLKVGGILCTSTYRSKKFNVSAGIGLNIDNQRPTTCLNAVLQRLGY...

XP_057795845.1
MLFVTSSPRFLSLIRPPPLLSLQNLSFSPKNLYLSSKMESESSTTLVLCGKSAAEDEFARRLKTNNALKLPDGSPVSVCLHSETESAGNDGVFRVNSYMNSISTSRFGRLLVYSPRLASTHDVVANNFGELPIGSVCVADVQFKGRGRSKNVWESPKGCLLFSFTIQMEDGRVVPLVQYVVCLAMTEAVNDVCRRNGMPSLDVRIKWPNDLYLDGLKVGGILCTSTYRSKKFNVSAGIGLNIDNQRPTTCLNAVLQRLGY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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