当前解析结果
SmilChr02G002947| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002947 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002947 |
| 描述 | epimerase family protein SDR39U1 homolog, chloroplastic-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 49991004 - 49993159 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131011964 |
|---|---|
| GeneID | 131011964 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011964 |
| 原始查询 | SmilChr02G002947 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | epimerase family protein SDR39U1 homolog, chloroplastic-like |
| 产物 | epimerase family protein SDR39U1 homolog%2C chloroplastic-like |
| Arabidopsis | AT2G21280 (SULA)NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816667] identity=67; qcov=1.15; evalue=2.3e-45; confidence=medium |
| Rice | Os02g0834700 (P0264G11.15-1)- identity=61; qcov=1.15; evalue=4.92e-42; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01370 (Epimerase) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011964 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057795850.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057795850.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057795850.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795850.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057795850.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057795850.1PF01370
Epimerase 4-95 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057795850.1 |
Pfam | PF01370 |
Epimerase | Family | 4 | 95 | 3.4e-07 | 30.6 | NAD dependent epimerase/dehydratase family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。