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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002949`

染色体: Chr02 坐标: 50029921-50030442 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002949`
名称	SmilChr02G002949
描述	protein SRC2 homolog
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	50029921 - 50030442 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009670`
GeneID	`131009670`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009670`
原始查询	`SmilChr02G002949`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SRC2 homolog
产物	protein SRC2 homolog
Arabidopsis	`AT1G09070` (SRC2) soybean regulated by cold-2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837428] identity=36.4; qcov=0.763; evalue=3.82e-20; confidence=low
Rice	`Os01g0934100` - identity=40.3; qcov=0.688; evalue=1.5e-15; confidence=low
GO	GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009670

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057793065.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793065.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793065.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793065.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793065.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:50029927`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B113,B22,B76
`Chr2:50029927`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B113,B22,B76
`Chr2:50029930`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B113,B22,B76
`Chr2:50029930`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B113,B22,B76
`Chr2:50029993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B124,B45,C48
`Chr2:50030068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr2:50030089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:50030131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C7,D11
`Chr2:50030248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr2:50030391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:50030434`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B91
`Chr2:50030434`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793065.1

173 aa

173

PF00168 C2 5-107 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793065.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	5	107	8.9e-15	55.5	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937082.1
ATGGAGTGCAGAAAACTCGAAATCACGCTGGTCTCCGCCCAACATCTCCCCGATGTCCGAACCAGCGGTCGGATGAAAGTGTACGCCAAGGTCTCGCTCAAGGGAGAGTCCAAAACCACCAAGAAGAGCCACGTGGACTACGAGGGCGGCACCAATCCCAGGTGGAATTTCGTCGCCCATTACACCGTCAGCGAGTCCACCGTCCGCCGCCCGGGACTCAGCGTCACGGTCAAGCTGGTGTGCAGGAGGACTCTAGGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009670
ATGGAGTGCAGAAAACTCGAAATCACGCTGGTCTCCGCCCAACATCTCCCCGATGTCCGAACCAGCGGTCGGATGAAAGTGTACGCCAAGGTCTCGCTCAAGGGAGAGTCCAAAACCACCAAGAAGAGCCACGTGGACTACGAGGGCGGCACCAATCCCAGGTGGAATTTCGTCGCCCATTACACCGTCAGCGAGTCCACCGTCCGCCGCCCGGGACTCAGCGTCACGGTCAAGCTGGTGTGCAGGAGGACTCTAGGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793065.1
MECRKLEITLVSAQHLPDVRTSGRMKVYAKVSLKGESKTTKKSHVDYEGGTNPRWNFVAHYTVSESTVRRPGLSVTVKLVCRRTLGDRFVGKVKIPVKSLFDMGQKSRKILSYDVAGGGRLNLLYSFSDRMFVRQPSSGWKTAFETVGFLVLVGGAMLLLAGDSDRDEDGDDC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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