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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002961`

染色体: Chr02 坐标: 50134661-50136384 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002961`
名称	SmilChr02G002961
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	50134661 - 50136384 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011971`
GeneID	`131011971`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011971`
原始查询	`SmilChr02G002961`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
产物	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
Arabidopsis	`AT2G42730` (AT2G42730) F-box/FBD/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818873] identity=31.6; qcov=0.735; evalue=2.37e-21; confidence=low
Rice	`Os04g0208600` (OsFbox191) - identity=29.9; qcov=0.646; evalue=3.08e-16; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011971

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795860.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057795860.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795860.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795860.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795860.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:50134934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:50134940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:50135235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr2:50135279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B119,C39,C9
`Chr2:50135281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr2:50135343`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B117,B24,B3
`Chr2:50135343`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B117,B24,B3
`Chr2:50135424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:50135486`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A18
`Chr2:50135486`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A18
`Chr2:50135510`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B100,B110,B121,B27,B31,B52,C45,C55
`Chr2:50135877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B64,C27,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795860.1

362 aa

181

362

F-box

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 6-43 aa PF24758 LRR_At5g56370 96-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795860.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	6	43	2e-05	25.0	F-box domain
`XP_057795860.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	96	218	1.1e-08	35.7	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939877.1
ACTATAACTTTTTGGTGTCTAAATTACAAAATGTAATAAATTTATTGGGAAATTAACTAAAAATAAAAAAACATAGTTGTAGTTGCATGATAACGGGAAAGAGAGGGAAGACCCGGGGATAGACAAAGTGAAGAGAAAATGAGTCTCAAATTTGGGCACCAAGAAAAGTTTGAACATATGATATATATGAGCAATGCATCAAAAATAATCTCAAGAAATGGAGGAGGACAGAATCAGCCAACTCCCAGATGCAATTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011971
ATGGAGGAGGACAGAATCAGCCAACTCCCAGATGCAATTCTTCAACAAATCTTGTCCTTGATCGACATCAATCAAGCCGTTGAGACAGCCGTTCTCTCCTCAAGATGGAAAAACCTCTGGTTTTCCCTCTCCGATCTCAACTTCCACCTCACCCGCTTCCCTCACTTCATCTCCAACTTCCTCTCTCATCGCGACGACGCCGCCCCCATCCGCAACTTCCACCTCTCATTGGACACCGGTGGGCCGGCCCACGAATTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795860.1
MEEDRISQLPDAILQQILSLIDINQAVETAVLSSRWKNLWFSLSDLNFHLTRFPHFISNFLSHRDDAAPIRNFHLSLDTGGPAHEFVEECAYYAVSHGVQSLRLHAPGGPLLNLPAAFFASTTLRELHLRQFSGGISLPGNFCLPHLKTLYLESTRFFKHDFLYTILKEPFSRFPELEKLTLRRCMLYRLVVKAPKLRFLEIIQERLEMEEISAPLLTWFRYEGHYPFECPNVNLPVLEEVNLDIYKRFYEEGMRVKCVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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