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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002962`

染色体: Chr02 坐标: 50139720-50141545 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002962`
名称	SmilChr02G002962
描述	putative F-box/LRR-repeat protein At5g02930
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	50139720 - 50141545 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011972`
GeneID	`131011972`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011972`
原始查询	`SmilChr02G002962`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box/LRR-repeat protein At5g02930
产物	putative F-box/LRR-repeat protein At5g02930
Arabidopsis	`AT2G42730` (AT2G42730) F-box/FBD/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818873] identity=29.1; qcov=0.673; evalue=1.57e-20; confidence=low
Rice	`Os04g0208500` (OsFbox190) - identity=27.7; qcov=0.797; evalue=1.46e-10; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011972

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795861.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795861.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795861.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795861.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795861.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:50139914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,D4
`Chr2:50140045`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C7
`Chr2:50140045`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C7
`Chr2:50140146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr2:50140227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B31,C64,C66
`Chr2:50140310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C2,C32,C36,C68
`Chr2:50140406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr2:50140429`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B70
`Chr2:50140429`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B70
`Chr2:50140685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr2:50141159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr2:50141165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795861.1

413 aa

206

413

F-box

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 6-44 aa PF24758 LRR_At5g56370 118-249 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795861.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	6	44	7.1e-07	29.6	F-box domain
`XP_057795861.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	118	249	2.6e-08	34.5	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939878.1
ATATCCAAATTTGGTCACCAAGAAAACTCCTCACATATATATTTATTACCAAGAAGATTGATCCTCCCCCAAAATCAAAACTCATCATAAAAAATGGAGCAAGACAGAATCAGCCAACTCCCAGACGCAATTCTGCTACAAATTCTGTCGTGTATCGACACCAATCAAGCTGTTCAAACAAGCATTCTCTCCACGAGATGGAAAAACCTCTGCTTTTCCCTCTCCGACCTCCACTTCCGCCTCAGCAGCTTCGCCGTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011972
ATGGAGCAAGACAGAATCAGCCAACTCCCAGACGCAATTCTGCTACAAATTCTGTCGTGTATCGACACCAATCAAGCTGTTCAAACAAGCATTCTCTCCACGAGATGGAAAAACCTCTGCTTTTCCCTCTCCGACCTCCACTTCCGCCTCAGCAGCTTCGCCGTCCACAGCCGCGCCACCTTAAAGAATCGAGAAGCTCTCTCCCACCGCTTCTCCCACTCCGTCTCCCACTTCCTCTCTCACCGCGACGGAGCCACCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795861.1
MEQDRISQLPDAILLQILSCIDTNQAVQTSILSTRWKNLCFSLSDLHFRLSSFAVHSRATLKNREALSHRFSHSVSHFLSHRDGATTIRNFHLSFEHSHDLQLYADAAFVEECVLHAIDHGVQSLRLQLRCRPELTLPASFFASTTLRELELRQLGCVICVPEQFSLPHLKTLYLESSAFVNDGQYFSSLKEPFSGFPELEKLTLRQCSVYRLVVKAPKLRFLEIVQKNSYYYSDQLMEEISAPLLTWFRYEGYFPFECS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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