当前解析结果
SmilChr02G002966| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002966 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002966 |
| 描述 | flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 50171870 - 50174456 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131011976 |
|---|---|
| GeneID | 131011976 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011976 |
| 原始查询 | SmilChr02G002966 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase-like |
| 产物 | flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase-like |
| Arabidopsis | AT5G08640 (FLS1)flavonol synthase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830765] identity=62.4; qcov=1; evalue=1.67e-154; confidence=high |
| Rice | Os02g0767300 (FLS)- identity=56.1; qcov=1; evalue=2e-135; confidence=high |
| GO | GO:0009416 (response to light stimulus); GO:0045431 (flavonol synthase activity) |
| KEGG | smil00941 (Flavonoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011976 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057795864.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057795864.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057795864.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057795864.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795864.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:50172111 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B44 |
Chr2:50172972 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B135,C58 |
Chr2:50173098 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057795864.1PF14226
DIOX_N 43-150 aa
PF03171
2OG-FeII_Oxy 200-296 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057795864.1 |
Pfam | PF14226 |
DIOX_N | Family | 43 | 150 | 5.3e-25 | 89.1 | non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal |
XP_057795864.1 |
Pfam | PF03171 |
2OG-FeII_Oxy | Domain | 200 | 296 | 3e-32 | 111.7 | 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。