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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002997`

染色体: Chr02 坐标: 50655176-50657280 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002997`
名称	SmilChr02G002997
描述	uncharacterized SmilChr02G002997
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	50655176 - 50657280 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009681`
GeneID	`131009681`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009681`
原始查询	`SmilChr02G002997`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0714225; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os01g0714225; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=25.3; qcov=0.457; evalue=1.04e-13; confidence=low
Rice	`Os01g0714225` - identity=32.2; qcov=0.284; evalue=1.05e-18; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009681

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793075.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057793075.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057793075.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793075.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793075.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:50655179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr2:50655190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A18,B69,B70,C13,C52,C62
`Chr2:50655227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B84,C20,D10
`Chr2:50655262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,D4
`Chr2:50655265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,C38,C75,C76,D11
`Chr2:50655337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C75,C76,C82,D11
`Chr2:50655353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C22,C71,D2
`Chr2:50655376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C75,C76,C82
`Chr2:50655414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B128,B132,B137,B15
`Chr2:50655445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B84,C20,D10
`Chr2:50655447`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B84,D10
`Chr2:50655447`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B84,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793075.1

416 aa

208

416

RVT_3

RVT_1

PF13456 RVT_3 2-98 aa PF00078 RVT_1 94-199 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793075.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	2	98	2.4e-12	47.6	Reverse transcriptase-like
`XP_057793075.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	94	199	7e-10	39.8	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937092.1
ATGAACACAGATGGTTCTTTCGATTCTCAGACGCAGCACGGTGCTGGCGGAGGAGTGGTTCGTGATCATAGTGGAGCCCTCATTGTTGCCTTCTGCTCCCTATGTGATGCTACTTCTAGTTTTGAGGCTAAGTTAACTGCCCTGCTCGAGGGCCTTAGGTTCGCTATCATTTTCTCTGATCATATATGGGTTGAGATGAATGCGGCGGCGATCGTTTTGCTCATGTCTGCTGTGCATCATGGTCATGCTAGTATTCGTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009681
ATGAACACAGATGGTTCTTTCGATTCTCAGACGCAGCACGGTGCTGGCGGAGGAGTGGTTCGTGATCATAGTGGAGCCCTCATTGTTGCCTTCTGCTCCCTATGTGATGCTACTTCTAGTTTTGAGGCTAAGTTAACTGCCCTGCTCGAGGGCCTTAGGTTCGCTATCATTTTCTCTGATCATATATGGGTTGAGATGAATGCGGCGGCGATCGTTTTGCTCATGTCTGCTGTGCATCATGGTCATGCTAGTATTCGTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793075.1
MNTDGSFDSQTQHGAGGGVVRDHSGALIVAFCSLCDATSSFEAKLTALLEGLRFAIIFSDHIWVEMNAAAIVLLMSAVHHGHASIRHTVVWIRQLIQHRQIRQLKEGKAGMVALKLDMSKAYDRVEWTYLEAVIQKLGFLDRLRRVIMKCMRLVPFSFLMNMSIFDDLVPSRGLRQGDPLSPFLFVLYAQGISFLFHRAQRKQVIHGVPIVPGGSRYPSLSQPPYVPSLAKETPIWIMEKIQKKLACWNQREFIGAGIEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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