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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003005`

染色体: Chr02 坐标: 50690724-50693540 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003005`
名称	SmilChr02G003005
描述	uncharacterized SmilChr02G003005
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	50690724 - 50693540 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012014`
GeneID	`131012014`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012014`
原始查询	`SmilChr02G003005`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840321]; symbol=AT1G34220; hit=AT1G34220; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840321]; symbol=AT1G34220; hit=AT1G34220; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G34220` (AT1G34220) Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840321] identity=51.2; qcov=1.07; evalue=6.59e-135; confidence=high
Rice	`Os08g0175200` - identity=59.2; qcov=0.631; evalue=6.35e-111; confidence=high
GO	GO:0015031 (protein transport)
KEGG	-
Pfam	PF03398 (Ist1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012014

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057795905.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057795905.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057795905.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057795905.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795905.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:50690930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	118	A13,A19,A2,A21,A24,A25,A3,A7,A8,B1,B10,B100,B101,B102,B104,B105,B107,B108,B109,B113,B114,B117,B12,B121,B122,B123,B124,B125,B129,B13,B131,B139,B14,B16,B17,B18,B21,B22,B26,B3,B31,B32,B35,B37,B38,B39,B41,B42,B43,B44,B47,B49,B50,B53,B56,B57,B62,B63,B69,B70,B74,B75,B78,B79,B81,B83,B85,B86,B88,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B99,C11,C15,C18,C19,C2,C21,C23,C26,C3,C34,C36,C44,C45,C46,C48,C49,C54,C56,C59,C6,C63,C65,C67,C69,C70,C73,C74,C75,C76,C79,C8,C80,C82,C84,C85,C87,C9,D1,D11,D5,D9
`Chr2:50691041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C40
`Chr2:50691082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B128,B132,B137,B15
`Chr2:50691131`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B34
`Chr2:50691131`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B34
`Chr2:50691133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr2:50691192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr2:50691458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B98,C14,C16,C48
`Chr2:50691511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B137
`Chr2:50691604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B114,B127,B20,B26
`Chr2:50692009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr2:50693367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795905.1

455 aa

228

455

Ist1

PF03398 Ist1 16-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795905.1`	Pfam	`PF03398`	Ist1	Family	16	179	8.8e-58	195.6	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939922.1
CTTGGAAACTAAGGAAAGTCGCAGCTCATACGCGTAGCATCCGCTTGTTGTGGAGCAGCTCCCCGTTTTCTGTTCATATATATTTATTTGATACACCGATTTTCTCCTCTCGATATCGATAAACAGATCATAATTTCGAAACACAGTAACGACGATGCTTGATTCTTTCTTCAGCAAAGGTTTCAAATCTTCCAAATGTAAAACTCTGTTGAAGCTTACAATCCCTCGGATAAAGTTGTTGAGGAATCGAAGAGTGATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012014
ATGCTTGATTCTTTCTTCAGCAAAGGTTTCAAATCTTCCAAATGTAAAACTCTGTTGAAGCTTACAATCCCTCGGATAAAGTTGTTGAGGAATCGAAGAGTGATTCATATAAACCAGATGCGTCGAGAAATCGCCAAGCTCCTTGAGACTGGCCAGGAAGCCTCGGCTAGGATTCGGGTAGAGAATATTCTAAGGGAAGAGAAGATGATGGCTGCTCAGGAATTAGTTGAATTGTACTGTGAGCTTATTATTGCTCGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795905.1
MLDSFFSKGFKSSKCKTLLKLTIPRIKLLRNRRVIHINQMRREIAKLLETGQEASARIRVENILREEKMMAAQELVELYCELIIARLPIIDAQKECPLDLKEAISSVCFAAPRCADLPELQQVQMLFAGKYSKEFVSSATELMPECGVNRQLVDLLSVRAPSSDVKLKLLKDIAKEHELDWDPSASENDLLKTHEDLLNGTMQFISDHTVPLAESHNDEAKSTNSTTSEPDAGEHPDSDEDFDIIDFPEVPRQPGVGSGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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