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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003029`

染色体: Chr02 坐标: 50997179-51002895 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003029`
名称	SmilChr02G003029
描述	probable manganese-transporting ATPase PDR2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	50997179 - 51002895 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009687`
GeneID	`131009687`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009687`
原始查询	`SmilChr02G003029`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable manganese-transporting ATPase PDR2
产物	probable manganese-transporting ATPase PDR2
Arabidopsis	`AT5G23630` (PDR2) phosphate deficiency response 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832428] identity=82.4; qcov=0.876; evalue=4.46e-135; confidence=high
Rice	`Os05g0402800` - identity=78.4; qcov=0.853; evalue=2.79e-115; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0006874 (intracellular calcium ion homeostasis); GO:0015662 (P-type ion transporter activity); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009687

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057793082.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057793082.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057793082.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793082.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793082.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:50997684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B64
`Chr2:50997720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,C30,C36,C40,C64
`Chr2:50998928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A11,B78,B95,C14,D10
`Chr2:50998928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B78,B95,C14,D10
`Chr2:50998970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B91
`Chr2:51000062`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B23
`Chr2:51000062`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B23
`Chr2:51000118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr2:51000419`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B21,B52
`Chr2:51000419`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B21,B52
`Chr2:51000420`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B21,B52
`Chr2:51000420`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B21,B52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937099.1
ATGGGGGTTGTGTGGCTGTTGTGCTGCGAACTGGATTTGAAACTAGTCAAGGAAAGTTACTGGGAAAGTGGGCTATTTATTTTGTTCTTGGTAGTATTTTCTCTTATAGCTGCCGGTTATGTCCTTAAAAAGGGTCTTGAGGATCCAACAAGGAGTAAATACAAGCTTCTTCTGAGTTGTTCATTGATTATTACTTCTGTTATTCCCCCCGAACTTCCGATGGAGCTGTCAATAGCTGTTAATACATCACTGATTGCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009687
ATGGGGGTTGTGTGGCTGTTGTGCTGCGAACTGGATTTGAAACTAGTCAAGGAAAGTTACTGGGAAAGTGGGCTATTTATTTTGTTCTTGGTAGTATTTTCTCTTATAGCTGCCGGTTATGTCCTTAAAAAGGGTCTTGAGGATCCAACAAGGAGTAAATACAAGCTTCTTCTGAGTTGTTCATTGATTATTACTTCTGTTATTCCCCCCGAACTTCCGATGGAGCTGTCAATAGCTGTTAATACATCACTGATTGCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793082.1
MGVVWLLCCELDLKLVKESYWESGLFILFLVVFSLIAAGYVLKKGLEDPTRSKYKLLLSCSLIITSVIPPELPMELSIAVNTSLIALARRGIYCTEPFRIPFAGKVDICCFDKTGTLTSDDMEFSGVGGLTDSEDLETEMSKVPDRTLEILASCHALVFVDNKLVGDPLEKASLKGIDWTYKSDEKAMPKKGGANFVQIVQRHHFASHLKRMAVVVRVQEQFFAFVKGAPETIQERLVDVPGWYVETYTHVKGPVFWLWL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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