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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003043`

染色体: Chr02 坐标: 51223339-51229024 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003043`
名称	SmilChr02G003043
描述	uncharacterized SmilChr02G003043
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	51223339 - 51229024 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010061`
GeneID	`131010061`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010061`
原始查询	`SmilChr02G003043`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane protein (DUF616) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840358]; symbol=EMB2756; hit=AT1G34550; species=arabidopsis; confidence=high
产物	transmembrane protein (DUF616) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840358]; symbol=EMB2756; hit=AT1G34550; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G34550` (EMB2756) transmembrane protein (DUF616) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840358] identity=57.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0531500` - identity=46.2; qcov=0.435; evalue=2.6e-82; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04765 (TOD1_MUCI70)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010061

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057793438.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057793438.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793438.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793438.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793438.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:51223632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C74
`Chr2:51224886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr2:51224944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr2:51225022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr2:51225298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,A2,B1,B122,B82
`Chr2:51225346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B47,C31
`Chr2:51225390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B47,C31
`Chr2:51225404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr2:51226202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:51227052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B53,C17,C63
`Chr2:51227910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr2:51227910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793438.1

701 aa

350

701

TOD1_MUCI70

PF04765 TOD1_MUCI70 367-686 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793438.1`	Pfam	`PF04765`	TOD1_MUCI70	Domain	367	686	7.1e-144	479.6	TOD1/MUCI70, glycosyltransferase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937455.1
CCCTCTTTCCTTTATTCCCACTCCCACCGCTGCCCCTGTCAGAAATCAATCACTCTCCGGTGAGCTTCCTCAAATTCCTCCGATTGTCCGCACGAGCTGGTCAAAATCACTGTTATACCCTTCAAAAACGCGCTTATTTCCAATCGTGCCCTTGCCGGAGCTGGGTACACGTACGCGCATTGTGTATCTACGTTCAATAATGCGCGGATGGCTCAGTTCAGGCAATCCGGCGGCAATGGCTCGCGAAACGGCGTCGTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010061
ATGGCTCAGTTCAGGCAATCCGGCGGCAATGGCTCGCGAAACGGCGTCGTCACGGATCACTTACCGCTCAGTGTCCGCGGCGGCTCCAGGCAGTTCCACCACCGGCGATCGAAGGCACCGCCGCCGTATAAGATCTCTATCGGATTCTGCGTTCTGATACTCGCTCTCATTCTGGCGATCTCCGCTTTTTTCTACTTCGTACTGCAGAGTAAAGGAGTGGAAAGCAATAGACACCAGACTGAAGATGAAGACATGAGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793438.1
MAQFRQSGGNGSRNGVVTDHLPLSVRGGSRQFHHRRSKAPPPYKISIGFCVLILALILAISAFFYFVLQSKGVESNRHQTEDEDMSNDTDFLMDVTRIQRPRELKFGHGSVTHGRDSRYWDRDDRRRDEDYTEEEQERAQDGSVDKVHITVKKRDKVSSDDRSHASSDHHKNGLYNEAGRNELKMYEAEYEASLKSNEKSTDSDDHRNQHSQDTDGREHRALDEVDEYDDGIDLQDDQMEESDDTGNDYMDHSSATILHS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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