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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003062`

染色体: Chr02 坐标: 51457704-51459502 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003062`
名称	SmilChr02G003062
描述	GRAS family protein RAM1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	51457704 - 51459502 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010080`
GeneID	`131010080`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010080`
原始查询	`SmilChr02G003062`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GRAS family protein RAM1-like
产物	GRAS family protein RAM1-like
Arabidopsis	`AT3G03450` (RGL2) RGA-like 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821251] identity=33.2; qcov=0.867; evalue=1.1e-53; confidence=low
Rice	`Os04g0432100` (OSJNBa0084A10.13) - identity=44.1; qcov=0.753; evalue=1.35e-76; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010080

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793455.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793455.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793455.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793455.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793455.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:51458006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr2:51458010`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C36
`Chr2:51458010`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C36
`Chr2:51458053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:51458185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr2:51458263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B109,C18,C22,D1
`Chr2:51458764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C7,D11
`Chr2:51458908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr2:51459109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B72,B80,C7,D11
`Chr2:51459226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793455.1

458 aa

229

458

GRAS

PF03514 GRAS 79-453 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793455.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	79	453	2.4e-92	310.5	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937472.1
TAGATGCTCCAATTTATTTTATGATTTCTCGACAGCATATACATGTCATTTCTTGACCTCTCCGACCTGCCCCGACACTACATATACCCTTTTCGCAGCGTTCAAACAACGGAAAAAGAAAAAAAAAAATTGCAATCCAATTCTTGACCTTGAACGTTGAATATTAAGCCCAAGAAAGATACCTTTTCTTTCTCCATCACTATACGTATGAATATGGAACAATTCAAGTAAATGATGTTGGGTCATGAAATTCCCCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010080
ATGTTGGAGATGGAGGAGGAGGAGTTCTTGACCCTCAGACTCTCCATAGCCCCGGCCCACGATCACAACCGCGAGGGGAAGAGGAAAAGGAACATAATAGAAATATCAAACTACTCGAGCTCGAGTGATGAAGAGGAGGGCAAGATCTTGGGCCTCCTCCAAATGAGAGAGAGAATGCTAAAGGCGGATCATCACAACAAGAGACAAGATACCGATGCAAAGGGGCTGCACTTGATCCACTCCCTCCTCATCGCCGCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793455.1
MLEMEEEEFLTLRLSIAPAHDHNREGKRKRNIIEISNYSSSSDEEEGKILGLLQMRERMLKADHHNKRQDTDAKGLHLIHSLLIAATSVNEKNATSGVENLRQLYEHVSLRGDSVQRVAAYFADALLAHLLTRKSPFYDAIMKPPSPSEAFSAFTSLYKASPFFQFAHFTANQAILEAFQRDASSRALHVVDFDVSYGFQWPSLMQSLSENATPTNKISLRITAFGPHMEEIQETESRLVSFAKGFCNLVFEFHGLVRGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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